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J-GLOBAL ID：202202278499069259   整理番号：22A0842129

乳癌におけるCRISPR-Cas9に基づく癌依存性マップ遺伝子の新しい予後シグネチャの構築と検証【JST・京大機械翻訳】

Construction and Validation of a Newly Prognostic Signature for CRISPR-Cas9-Based Cancer Dependency Map Genes in Breast Cancer

著者 (4件)： Yan Xin (Liyang People’s Hospital, Liyang 213399, China) ,  You Sai-Nan (Suqian Hospital of Nanjing Drum Tower Hospital Group, Suqian 223800, China) ,  Chen Yan (Jiangsu Province Geriatric Hospital, Nanjing 210029, China) ,  Qian Ke (Liyang People’s Hospital, Liyang 213399, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌依存性マップ(CDM)遺伝子は広範囲のゲノム規模のRNAiに基づく機能喪失試験から成る。したがって,それは潜在的遺伝子機能の調査において科学者を支援することができるCRISPR-Cas9技術に基づく方法として役立った。これらのCDM遺伝子は,腫瘍細胞の生存と増殖に役割を持ち,それらがいくつかの悪性腫瘍の新しい治療標的として使用できることを示唆する。今まで,乳癌におけるCDM遺伝子の関与に関する研究はほとんどなく,CDM遺伝子のわずかな割合しか研究されていない。本研究では,乳癌の患者の情報を,乳癌の差次的に発現したCDM遺伝子を測定した癌ゲノムアトラス(TCGA)から抽出した。様々なバイオインフォマティクス技術を用いて,これらの確認されたCDM遺伝子の機能および予後関連性を評価した。すべてにおいて,290のCDM遺伝子は差別的に発現していた。6つのCDM遺伝子(SRF,RAD51,PMF1,EXOSC3,EXOC1,およびTSEN54)は,乳癌サンプルの予後と関連することがわかった。同定されたCDM遺伝子とそれらの係数の発現に基づき,乳癌患者を2つのリスク群に分離して,予後モデルを予測のために構築した。高リスクの患者は,TCGA訓練セット,TCGA試験セット,および遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースからの外部コホートにおいて,他のリスクグループにおける患者よりも,実質的に低い全生存率(OS)を有した。この予後徴候に対する受信者動作特性(ROC)曲線下面積は,TCGA訓練および試験セットに対し,それぞれ0.717および0.635であり,乳癌患者の予後を予測する信頼性を示した。次に,治療的に有用なモデルを作成するために発見された6つのCDM遺伝子を用いてノモグラムを作成した。ヒト蛋白質Atlasデータベースを用いて,発見されたCDM遺伝子のすべての免疫組織化学染色画像を得た。腫瘍浸潤免疫細胞の割合およびチェックポイント遺伝子の発現レベルは,免疫応答の分析により,2つのリスク群の間で実質的に変化した。結論として,この研究の知見は乳癌におけるCDM遺伝子の予後的価値と生物学的役割の理解を助けるかもしれない。Copyright 2022 Xin Yan et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝子 ,  腫瘍細胞 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  免疫反応 ,  *予後 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  腫瘍浸潤 ,  *乳房腫瘍 ,  RNA干渉
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  バイオインフォマティクス ,  全生存率 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

引用文献 (52件)：

• Z. Niu, X. Li, S. Feng, Q. Huang, T. Zhuang, C. Yan, H. Qian, Y. Ding, J. Zhu, W. Xu, "The deubiquitinating enzyme USP1 modulates ERα and modulates breast cancer progression," Journal of Cancer, vol. 11, no. 23, pp. 6992-7000, 2020.
• R. M. T. Staruch, M. J. Rouhani, M. Ellabban, "The surgical management of male breast cancer: time for an easy access national reporting database?," Annals of Medicine and Surgery, vol. 9, pp. 41-49, 2016.
• L. F. Jensen, A. F. Pedersen, B. Andersen, P. Vedsted, "Identifying specific non-attending groups in breast cancer screening-population-based registry study of participation and socio-demography," BMC Cancer, vol. 12, no. 1, pp. 518, 2012.
• V. S. Shirure, N. M. Reynolds, M. M. Burdick, "Mac-2 binding protein is a novel E-selectin ligand expressed by breast cancer cells," PLoS One, vol. 7, no. 9, 2012.
• S. K. Jeh, S. H. Kim, B. J. Kang, "Comparison of the diagnostic performance of response evaluation criteria in solid tumor 1.0 with response evaluation criteria in solid tumor 1.1 on MRI in advanced breast cancer response evaluation to neoadjuvant chemotherapy," Korean Journal of Radiology, vol. 14, no. 1, pp. 13-20, 2013.

タイトルに関連する用語 (10件)： 乳癌 ,  CRISPR-Cas9 ,  癌 ,  依存性 ,  マップ ,  遺伝子 ,  予後 ,  シグネチャ ,  構築 ,  検証