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J-GLOBAL ID:202202278553881884   整理番号:22A1025053

Sepsisにおける特徴的代謝関連遺伝子と不均衡免疫細胞サブセットの景観【JST・京大機械翻訳】

The Landscape of Featured Metabolism-Related Genes and Imbalanced Immune Cell Subsets in Sepsis
著者 (12件):
資料名:
巻: 13  ページ: 821275  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7071A  ISSN: 1664-8021  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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Sepsisは,重症患者において高い死亡率と罹患率を有する非制御炎症性宿主応答によって引き起こされる不均一な病態である。残念なことに,治療有効性は敗血症患者の間で変化し,根底にあるメカニズムはまだ解明されていない。本目的は敗血症患者のバイオマーカーになると思われる代謝関連遺伝子の特徴を調査することである。本研究では,全血試料中の敗血症と非敗血症の間の差次的発現遺伝子(DEG)を,以前に発表された2つのデータセット(GSE95233とGSE54514)を用いて同定した。合計66の共通DEG,すなわち52の上方制御と14の下方制御されたDEGを測定した。遺伝子セット濃縮分析(GSEA)の結果は,これらのDEGが敗血症患者における炭水化物誘導体,脂質,有機酸合成酸化還元および小分子生合成を含むいくつかの代謝過程に関与することを示した。その後,合計8つのハブ遺伝子を,サイトスコーププラグインサイトHubbaから最も高いスコアを有するモジュールにおいてスクリーニングした。さらなる研究は,これらのハブDEGが,受信者動作特性曲線(AUROC)の下で,高い面積を有する敗血症のためのロバスト標識であるかもしれないことを示した。これらのハブ遺伝子の診断値を,液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)を用いた非標的化メタボロミクス分析により,敗血症ラットおよび正常対照の心筋組織でさらに検証した。免疫細胞浸潤分析は,異なる浸潤パターンが,敗血症患者と正常対照の間で,主にB細胞,T細胞,NK細胞,単球,マクロファージ,樹状突起,好酸球,および好中球によって特徴付けられたことを明らかにした。この研究は,代謝ハブ遺伝子が敗血症患者における予後予測と正確な治療に対する有望なバイオマーカーであることを示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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感染症・寄生虫症一般  ,  遺伝子発現  ,  臨床診断学 
引用文献 (48件):
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  • BastidJ., Cottalorda-RegairazA., AlbericiG., BonnefoyN., EliaouJ.-F., BensussanA. (2013). ENTPD1/CD39 Is a Promising Therapeutic Target in Oncology. Oncogene 32 (14), 1743-1751. doi: 10.1038/onc.2012.269
  • BellelliR., BelanO., PyeV. E., ClementC., MaslenS. L., SkehelJ. M., et al (2018). POLE3-POLE4 Is a Histone H3-H4 Chaperone that Maintains Chromatin Integrity during DNA Replication. Mol. Cel 72 (1), 112-e5. doi: 10.1016/j.molcel.2018.08.043
  • ChenC., ChenH., ZhangY., ThomasH. R., FrankM. H., HeY., et al (2020). TBtools: An Integrative Toolkit Developed for Interactive Analyses of Big Biological Data. Mol. Plant 13 (8), 1194-1202. doi: 10.1016/j.molp.2020.06.009
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