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J-GLOBAL ID：202202278581945306   整理番号：22A1029170

NLRP6依存性ピロトーシス関連lncRNAは肝細胞癌の予後を予測する【JST・京大機械翻訳】

NLRP6-Dependent Pyroptosis-Related lncRNAs Predict the Prognosis of Hepatocellular Carcinoma

著者 (8件)： Zhang La (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Zhang Xiuzhen (School of Basic Medical Science, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Zhao Wei (School of Basic Medical Science, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Xiao Xinyu (School of Basic Medical Science, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Liu Shanshan (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Peng Qiling (School of Basic Medical Science, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Jiang Ning (Department of Pathology, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Zhou Baoyong (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing, China)
資料名： Frontiers in Medicine (Web)  (Frontiers in Medicine (Web))
巻： 9  ページ： 760722  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7079A  ISSN： 2296-858X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プログラム細胞死の新しい炎症型であるピロプトーシスは,種々の癌の腫瘍形成に関与する。最近の知見は,癌発生の連続的ステップにおいて長い非コードRNA(lncRNA)を関連づけている。しかし,肝細胞癌(HCC)におけるピロプトーシス関連lncRNAの発現および予後徴候は,ほとんど知られていない。したがって,HCCに対するピロプトーシス関連lncRNA予後モデルを作成した。34のピロプトーシス関連遺伝子が以前のレビューから得られ,遺伝子発現データは癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースから集められた。スピアマンの相関試験を用いて,潜在的ピロプトーシス関連lncRNAを同定した。CoxとLASSO回帰分析を用いて,予後モデルを構築した。続いて,受信者動作特性(ROC)曲線を構築し,HCC患者の全生存(OS)に対するモデル予測能力を評価した。サイトHubbaを用いて潜在的ハブ遺伝子を選別し,その発現をHCC患者の臨床試料を用いて検証した。最後に,HCCにおける9つのピロプトーシス関連差次的発現lncRNAを同定し,4つのピロプトーシス関連lncRNAを有する予後モデルを,約0.734のROC曲線下面積(AUC)で構築した。単一試料遺伝子セット濃縮分析とTCGAは,2つのリスク群の間で異なる免疫浸潤と免疫チェックポイントを明らかにした。さらに,これらのlncRNAは,ハブ遺伝子と考えられているピロプトーシス関連遺伝子,NLRP6と密接に関連する。NLRP6はHCC試料で低発現であり,NLRP6発現が低い患者はOSが長かった。結論として,NLRP6依存性ピロプトーシス関連lncRNAは腫瘍免疫において重要な役割を果たし,HCCに対する潜在的予測因子および治療標的である可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  浸潤 ,  遺伝子 ,  炎症 ,  *予後 ,  *肝細胞癌 ,  腫瘍免疫 ,  腫瘤形成
準シソーラス用語： 非翻訳RNA ,  アトラス ,  プログラム細胞死 ,  予測因子 ,  治療標的 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肝細胞癌 ,  lncRNA ,  NLRP6 ,  ピロトーシス ,  予後モデル

分類 (3件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  消化器の腫よう  (GH04000D) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (41件)：

• Forner A, Reig M, Bruix J. Hepatocellular carcinoma. The Lancet. (2018) 391:1301-14. doi: 10.1016/S0140-6736(18)30010-2
• Brar G, Greten TF, Graubard BI, McNeel TS, Petrick JL, McGlynn KA, et al. Hepatocellular carcinoma survival by etiology: a SEER-medicare database analysis. Hepatol Commun. (2020) 4:1541-51. doi: 10.1002/hep4.1564
• Reig M, da Fonseca LG, Faivre S. New trials and results in systemic treatment of HCC J Hepatol. (2018) 69:525-33. doi: 10.1016/j.jhep.2018.03.028
• Kopp F, Mendell JT. Functional classification and experimental dissection of long non-coding RNAs. Cell. (2018) 172:393-407. doi: 10.1016/j.cell.2018.01.011
• Tan DSW, Chong FT, Leong HS, Toh SY, Lau DP, Kwang XL, et al. Long non-coding RNA EGFR-AS1 mediates epidermal growth factor receptor addiction and modulates treatment response in squamous cell carcinoma Nat Med. (2017) 23:1167-75. doi: 10.1038/nm.4401

タイトルに関連する用語 (6件)： 依存性 ,  ピロトーシス ,  lncRNA ,  肝細胞癌 ,  予後 ,  予測