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J-GLOBAL ID：202202279100567347   整理番号：22A1161298

アミロイド形成疎水性パッチがアミロイド-βフィブリル伸長を促進する機構動力学モデル【JST・京大機械翻訳】

Mechanistic Kinetic Model Reveals How Amyloidogenic Hydrophobic Patches Facilitate the Amyloid-β Fibril Elongation

著者 (4件)： Xie Hengyi (Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medicine, New York, United States) ,  Rojas Ana (Schroedinger, Inc., New York, United States) ,  Maisuradze Gia G. (Baker Laboratory of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, New York, United States) ,  Khelashvili George (Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medicine, New York, United States)
資料名： ACS Chemical Neuroscience  (ACS Chemical Neuroscience)
巻： 13  号： 7  ページ： 987-1001  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5038A  ISSN： 1948-7193  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アミロイドβ(Aβ)ペプチドのフィブリルへの異常な凝集はAlzheimer病の発症に重要な役割を果たす。Aβフィブリル伸長過程に対して,2段階「ドックロック」モデルを提案した。しかしながら,Aβ単量体-フィブリル結合過程の機構は,必要な分子レベル精度により解明されていないので,ロック相動力学がフィブリルへのAβ単量体の全体的なin-regist結合をもたらすかは不明のままである。フィブリル伸長過程中のこの臨界段階への機構的洞察を得るために,物理ベース粗粒UNited-RESidue(UNRES)力場による分子動力学(MD)シミュレーションを用い,フィブリル結合Aβ_(9-40)ペプチドが再構成して,天然ドッキング立体配座を再構成したロック相プロセスの動力学を広範囲にサンプリングした。Markov状態モデルによるMD軌跡の解析を用いて,転位過程の速度論と,流入ペプチドの全体的な天然ドッキング立体配座を導く最もありそうな経路を定量化した。これらは,中心コアアミロイド形成パッチ_18VFFA_21とC末端疎水性パッチ34LMVG_37の間に,単量体内ヘアピンが形成される重要な中間状態を明らかにした。このヘアピン構造はフィブリル伸長のロック相中の遷移状態として非常に有利であった。アミロイド形成疎水性パッチによるAβフィブリル伸長の促進のための分子機構を提案した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  立体配座 ,  ドッキング ,  *疎水性 ,  ペプチド ,  *アミロイド ,  単量体 ,  ヘアピン構造 ,  *モデル ,  力の場 ,  分子動力学 ,  Alzheimer病 ,  アミロイドβタンパク質
準シソーラス用語： *アミロイド形成 ,  *フィブリル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Aβペプチド ,  アミロイド ,  レプリカ交換分子動力学 ,  UNRES力場 ,  Markov状態モデル ,  遷移経路理論

分類 (2件)： 神経の基礎医学  (GN01020W) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (7件)： アミロイド形成 ,  疎水性 ,  パッチ ,  アミロイド ,  フィブリル ,  促進 ,  動力学モデル