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J-GLOBAL ID：202202279367513641   整理番号：22A1177561

質量分析を用いた結核菌複合体の迅速同定:概念の証明【JST・京大機械翻訳】

Rapid Identification of Mycobacterium tuberculosis Complex Using Mass Spectrometry: A Proof of Concept

著者 (17件)： Robinne Simon (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Robinne Simon (Assistance Publique-Hopitaux de Marseille, Marseille, France) ,  Saad Jamal (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Saad Jamal (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France) ,  Morsli Madjid (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Morsli Madjid (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France) ,  Hamidou Zelika Harouna (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Hamidou Zelika Harouna (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France) ,  Hamidou Zelika Harouna (Laboratoire National de Reference des IST/VIH et de la Tuberculose, Niamey, Niger) ,  Tazerart Fatah (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France) ,  Tazerart Fatah (Institut des Sciences Veterinaires, Universite de Blida 1, Blida, Algeria) ,  Drancourt Michel (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Drancourt Michel (Assistance Publique-Hopitaux de Marseille, Marseille, France) ,  Drancourt Michel (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France) ,  Baron Sophie Alexandra (Aix-Marseille-University, IRD, MEPHI, Marseille, France) ,  Baron Sophie Alexandra (Assistance Publique-Hopitaux de Marseille, Marseille, France) ,  Baron Sophie Alexandra (IHU Mediterranee Infection, Marseille, France)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 753969  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mycobacterium tuberculosis複合体を形成するマイコバクテリアは,動物と患者における死んだ結核の原因である。種レベルでのこれらの病原体の同定は,処理およびソース追跡に対して一次的に重要であり,現在,全ゲノム配列決定(WGS)を含むDNA分析に依存し,これは全日を必要とする。本研究では,マトリックス支援レーザ脱離イオン化飛行時間質量分析(MALDI-TOF-MS)を用いたM.tuberculosis複合種の前例のない識別を,WGSを比較標準として報告した。第一段階では,WGSによる11のM.tuberculosis複合変異体のうち5つで同定された36の分離株に適用した最適化ペプチド抽出は,139のMALDI-TOFスペクトルをもたらし,変異体間の分化を促進する興味のバイオマーカーの同定に用いた。第二段階では,70/80(88%)の他の分離株が特異的ピークに基づくアルゴリズムによって正しく分類された。本研究は,臨床微生物学研究室で容易に実行されるM.tuberculosis複合マイコバクテリアを識別するためのMALDI-TOF-MS法を初めて報告した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  イオン化 ,  最適化 ,  脱着 ,  微生物 ,  ペプチド ,  *結核 ,  スペクトル ,  *複合体 ,  *結核菌 ,  Mycobacterium ,  病原体 ,  バイオマーカー ,  MALDI-TOF MS
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Mycobacterium ,  Mycobacterium tuberculosis ,  結核 ,  MALDI-TOF質量分析 ,  全ゲノム配列決定 ,  同定

分類 (5件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  食品の汚染  (FJ01053P) ,  細菌による動物の伝染病  (FE02023A) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (41件)：

• Alcaide F., Amlerová J., Bou G., Ceyssens P. J., Coll P., Corcoran D., et al (2018). How to: identify non-tuberculous Mycobacterium species using MALDI-TOF mass spectrometry. Clin. Microbiol. Infect. 24 599-603. doi: 10.1016/j.cmi.2017.11.012
• Bacanelli G., Olarte L. C., Silva M. R., Rodrigues R. A., Carneiro P. A. M., Kaneene J. B., et al (2019). Matrix assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry identification of Mycobacterium bovis in Bovinae. J. Vet. Med. Sci. 81 1400-1408. doi: 10.1292/jvms.19-0214
• Bottai D., Frigui W., Sayes F., Di Luca M., Spadoni D., Pawlik A., et al (2020). TbD1 deletion as a driver of the evolutionary success of modern epidemic Mycobacterium tuberculosis lineages. Nat. Commun. 11:684. doi: 10.1038/s41467-020-14508-5
• Bouzid F., Astier H., Osman D. A., Javelle E., Hassan M. O., Simon F., et al (2018). Extended spectrum of antibiotic susceptibility for tuberculosis, Djibouti. Int. J. Antimicrob. Agents 51 235-238. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2017.07.007
• Brites D., Loiseau C., Menardo F., Borrell S., Boniotti M. B., Warren R., et al (2018). A new phylogenetic framework for the animal-adapted Mycobacterium tuberculosis complex. Front. Microbiol. 9:2820. doi: 10.3389/fmicb.2018.02820

タイトルに関連する用語 (6件)： 質量分析 ,  結核菌 ,  複合体 ,  同定 ,  概念 ,  証明