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J-GLOBAL ID：202202279558613323   整理番号：22A1178566

アンフェタミン型刺激薬(ATS)における潜在的ハブ遺伝子の同定および検証とバイオインフォマティクス解析によるオピオイド依存性【JST・京大機械翻訳】

Identification and Verification of Potential Hub Genes in Amphetamine-Type Stimulant (ATS) and Opioid Dependence by Bioinformatic Analysis

著者 (13件)： Zhang Wei (1Department of Forensic Pathology, West China School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Deng Xiaodong (1Department of Forensic Pathology, West China School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Deng Xiaodong (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Liu Huan (3Department of Preventive Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Ke Jianlin (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Xiang Mingliang (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Ma Ying (4Department of Neurology, Affiliated Hospital of North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Zhang Lixia (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Yang Ming (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Yang Ming (5Department of Criminal Investigation, Nanchong Municipal Public Security Bureau, Nanchong, China) ,  Liu Yun (2Department of Forensic Pathology, School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Liu Yun (6Medical Imaging Key Laboratory of Sichuan Province, North Sichuan Medical College, Nanchong, China) ,  Huang Feijun (1Department of Forensic Pathology, West China School of Basic Medical Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 837123  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:アンフェタミン型刺激薬(ATS)とオピオイド依存性は,類似の症状と共通のゲノムを有する慢性炎症性疾患である。しかし,それらの共発現遺伝子は完全には研究されていない。著者らは,ATSおよびオピオイド依存性の病因に関与する共発現ハブ遺伝子および経路を同定し,検証することを目的とした。方法:ATSおよびオピオイド処理マウスモデルのマイクロアレイを,遺伝子発現Omnibusデータベースから得た。GEO2RとVennダイアグラムを,差次的発現遺伝子(DEG)と抑制性DEG(CDEG)を同定するために実行した。機能的アノテーションと蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークは,潜在的機能を検出した。ハブ遺伝子を,異なるアルゴリズムでCytoHubbaおよびMCODEプラグインを用いてスクリーニングし,さらに,GSE15774データベースにおける受信者動作特性分析によって検証した。また,qPCRを用いてBV2細胞におけるハブ遺伝子mRNAレベルを検証した。【結果】44のCDEGsは,PI3K/Aktシグナル伝達経路において顕著に強化されたATSとオピオイドデータベースの間で同定された。トップ10ハブ遺伝子は,主にアポトーシス過程(CD44,Dusp1,Sgk1,Hspa1b),ニューロン分化,移動,および増殖(Nr4a2とDdit4),外部刺激(FosとCdkn1a),および転写調節(Nr4a2とNpas4)に富んでいた。受信者動作特性(ROC)分析は,6つのハブ遺伝子(Fos,Dusp1,Sgk1,Ddit4,Cdkn1a,およびNr4a2)がGSE15774において0.70以上の曲線下面積(AUC)を有することを見出した。BV2細胞におけるFos,Dusp1,Sgk1,Ddit4,Cdkn1a,PI3KおよびAktのmRNAレベルおよびMETHおよびヘロイン処理によるGSE15774は,対照より高かった。しかしながら,Nr4a2 mRNAレベルはBV2細胞で増加し,生物情報学分析で低下した。結論:ハブ遺伝子の同定は,アポトーシス,ニューロン分化,移動および増殖に関与するATSおよびオピオイド依存性と関連していた。PI3K/Aktシグナリング経路は,物質依存性の病因において重要な役割を果たす可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  データベース ,  ネットワーク ,  ニューロン ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  分化 ,  *麻薬性鎮痛薬 ,  遺伝子発現 ,  アポトーシス ,  病因 ,  アノテーション ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アンフェタミン型刺激薬(ATS) ,  オピオイド ,  差次的発現遺伝子(DEG) ,  PI3K/Akt経路 ,  アポトーシス ,  ハブ遺伝子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  循環系の基礎医学  (GJ01020K)

引用文献 (99件)：

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• BarrettT., TroupD. B., WilhiteS. E., LedouxP., EvangelistaC., KimI. F., et al (2010). NCBI GEO: Archive for Functional Genomics Data Sets--10 Years on. Nucleic Acids Res. 39, D1005-D1010. doi: 10.1093/nar/gkq1184

タイトルに関連する用語 (9件)： アンフェタミン ,  刺激薬 ,  ATS ,  ハブ ,  遺伝子 ,  同定 ,  検証 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  オピオイド依存