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J-GLOBAL ID：202202279860617355   整理番号：22A1178533

肝細胞癌患者の予後を予測するためのネクローシス関連miRNAシグネチャーの構築【JST・京大機械翻訳】

Construction of a Necroptosis-Related miRNA Signature for Predicting the Prognosis of Patients With Hepatocellular Carcinoma

著者 (5件)： Meng Tongyu (Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang, China) ,  Wang Qingfeng (Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang, China) ,  Yang Yufeng (Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang, China) ,  Ren Yanling (Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang, China) ,  Shi Yan (Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 825261  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:多くのmiRNAは肝細胞癌(HCC)の予後と関連することが示されている。しかし,HCC患者生存の推定における最良の予測効果を達成するために,ネクロプトーシス関連miRNAを組み合わせる方法は検討されていない。方法:mRNAとmiRNA発現プロファイルを,公開データベース(TCGA-LIHCコホート)からダウンロードした。ネクローシス関連遺伝子は以前の参照から得られ,ネクロプトーシス関連miRNAはピアソン分析を用いて同定された。その後,差次的発現miRNA(DEms)を,壊死症関連miRNA発現に基づくHCCおよびパラガン正常試料において同定した。HCCによる全体のセットは,訓練セットと試験セット(1:1)にランダム化した。LASSO-Cox回帰分析を用いて,miRNAシグネチャを構築した。多重統計的方法を用いて,受信者動作特性(ROC)曲線,Kaplan-Meier生存解析,および決定曲線分析(DCA)を含むHCC患者における署名の臨床的利点を検証した。miRNAの下流標的遺伝子を異なるオンラインツールから得,miRNAに関与する潜在的経路を調べた。最後に,SK-HEP-1,THLE-3およびHUH-7細胞株におけるRT-qPCRを,シグネチャに関与するmiRNAsに対して行った。結果:結果は,合計8つの特異的壊死症関連miRNAが,訓練セットでHCCと隣接組織の間でスクリーニングされたことを示した。その後,前述のmiRNAに基づいて,5-miRNAシグネチャ(miR-139-5p,hsa-miR-326,miR-10b-5p,miR-500a-3p,miR-592)をLASSO-Cox回帰分析により発生させた。多変量Cox回帰分析は,リスクスコアが各セットにおける独立予後指標であることを示した。1年,3年,5年および7年の曲線下面積(AUC)は,各セットで高かった(AUC>0.7)。DCA分析はまた,リスクスコアが他の臨床的特徴より潜在的利点を有することを明らかにした。一方,生存分析は,高リスク群が低い生存確率を示したことを示した。さらに,濃縮分析の結果は,特異的miRNAが主にcAMPシグナル伝達経路とTNFシグナル伝達経路に富んでいることを示した。最後に,RT-qPCRの結果は,公開データベースにおける予測結果と一致した。結論:本研究は,HCC患者の予後管理のための5-ネクロトーシス関連miRNAに基づくロバストツールを確立する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  遺伝子 ,  *壊死 ,  多重化 ,  生存率 ,  *予後 ,  母集団 ,  ロバスト性 ,  *肝細胞癌 ,  定量的PCR法 ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド ,  環状ヌクレオチド
準シソーラス用語： 細胞株 ,  *マイクロRNA ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肝細胞癌 ,  miRNA ,  署名 ,  ネクローシス ,  予後

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： cAMP

引用文献 (56件)：

• BartelD. P. (2004). MicroRNAs. Cell 116 (2), 281-297. doi: 10.1016/s0092-8674(04)00045-5
• CaiX., ChenY., ManD., YangB., FengX., ZhangD., et al (2021). RBM15 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating N6-Methyladenosine Modification of YES1 mRNA in an IGF2BP1-dependent Manner. Cell Death Discov. 7, 315. doi: 10.1038/s41420-021-00703-w
• ChenB., LiaoZ., QiY., ZhangH., SuC., LiangH., et al (2020). miR-631 Inhibits Intrahepatic Metastasis of Hepatocellular Carcinoma by Targeting PTPRE. Front. Oncol. 10, 565266. doi: 10.3389/fonc.2020.565266
• ChenY., WangX. (2020). miRDB: an Online Database for Prediction of Functional microRNA Targets. Nucleic Acids Res. 48 (D1), D127-D131. doi: 10.1093/nar/gkz757
• ChristoffersonD. E., YuanJ. (2010). Necroptosis as an Alternative Form of Programmed Cell Death. Curr. Opin. Cel Biol. 22 (2), 263-268. doi: 10.1016/j.ceb.2009.12.003

タイトルに関連する用語 (7件)： 肝細胞癌 ,  患者の予後 ,  予測 ,  ネクローシス ,  miRNA ,  シグネチャー ,  構築