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J-GLOBAL ID：202202280226578283   整理番号：22A1027224

Shigella flexneriの視覚検出のためのCRISPR/Cas12a増強ループ媒介等温増幅【JST・京大機械翻訳】

CRISPR/Cas12a-Enhanced Loop-Mediated Isothermal Amplification for the Visual Detection of Shigella flexneri

著者 (10件)： Shi Yaoqiang (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Kang Lan (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Mu Rongrong (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Xu Min (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Duan Xiaoqiong (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Li Yujia (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Yang Chunhui (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China) ,  Ding Jia-Wei (2Clinical Laboratory Department, Yan’an Hospital Affiliated to Kunming Medical University, Kunming, China) ,  Wang Qinghua (3Department of Emergency, The Traditional Chinese Medicine Hospital of Wenjiang District, Chengdu, China) ,  Li Shilin (1Provincial Key Laboratory for Transfusion-Transmitted Infectious Diseases, Institute of Blood Transfusion, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Chengdu, China)
資料名： Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web)  (Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web))
巻： 10  ページ： 845688  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7059A  ISSN： 2296-4185  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Shigella flexneriは世界的な公衆衛生に対する重大な脅威であり,迅速な検出法が緊急に必要である。CRISPR/Cas(クラスター化規則的空間間短パリンドローム反復/CRISPR関連)システムは,遺伝子編集,遺伝子治療,およびin vitro診断で広く使用されている。ここでは,S.flexneriの診断のための新規診断試験(CRISPR/Cas12a-E-LAMP)を開発するためにループ媒介等温増幅(LAMP)とCRISPR/Cas12aを組み合わせた。CRISPR/Cas12a-E-LAMPプロトコルは,S.flexneri鋳型に対してLAMP反応を行い,次いでCRISPR/Cas12a検出を予め定めた標的配列の検出を行う。LAMPプライマーとsgRNAsを,S.flexneriの高度に保存された遺伝子仮想蛋白質(アクセス:AE014073,領域:4170556-4171,068)に設計した。60°C,20分間のLAMP反応後,事前負荷CRISPR/Cas12a試薬を,37°C,20分間,1管でLAMP製品と混合し,最終結果を,全時間40分を有する肉眼で見ることができた。S.flexneriを検出するためのCRISPR/Cas12a-E-LAMPの感受性は4×100コピー/μlプラスミドであり,他の6つの密接に関連した非S.flexneriとの交差反応はなかった。したがって,CRISPR/Cas12a-E-LAMPアッセイは,S.flexneriの信頼でき迅速な診断のための有用な方法であり,他の病原体感染検出に適用できる可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *視覚 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  クラスタ化 ,  検出法 ,  *赤痢菌属 ,  プラスミド ,  公衆衛生 ,  病原体 ,  *フレキシナ赤痢菌 ,  遺伝子操作 ,  遺伝子療法 ,  パリンドローム ,  in vitro実験
準シソーラス用語： *CRISPR配列 ,  遺伝子編集 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： CRISPR/Cas12a ,  ループ媒介等温増幅 ,  Shigella flexneri ,  ケア試験のポイント ,  視覚検出

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

引用文献 (41件)：

• BolotinA., QuinquisB., SorokinA., EhrlichS. D. (2005). Clustered Regularly Interspaced Short Palindrome Repeats (CRISPRs) Have Spacers of Extrachromosomal Origin. Microbiology (Reading). 151, 2551-2561. doi: 10.1099/mic.0.28048-0
• CaoM., WangW., ZhangL., LiuG., ZhouX., LiB., et al (2021). Epidemic and Molecular Characterization of Fluoroquinolone-Resistant Shigella dysenteriae 1 Isolates from Calves with Diarrhea. BMC Microbiol. 21, 6. doi: 10.1186/s12866-020-02050-9
• ChangW.-H., WangC.-H., YangS.-Y., LinY.-C., WuJ.-J., LeeM. S., et al (2014). Rapid Isolation and Diagnosis of Live Bacteria from Human Joint Fluids by Using an Integrated Microfluidic System. Lab. Chip. 14, 3376-3384. doi: 10.1039/c4lc00471j
• ChangY.-Y., StéveninV., DuchateauM., Giai GianettoQ., HourdelV., RodriguesC. D., et al (2020). Shigella Hijacks the Exocyst to Cluster Macropinosomes for Efficient Vacuolar Escape. Plos Pathog. 16, e1008822. doi: 10.1371/journal.ppat.1008822
• ChenJ. S., MaE., HarringtonL. B., Da CostaM., TianX., PalefskyJ. M., et al (2018). CRISPR-Cas12a Target Binding Unleashes Indiscriminate Single-Stranded DNase Activity. Science. 360, 436-439. doi: 10.1126/science.aar6245

タイトルに関連する用語 (6件)： Shigella ,  視覚 ,  CRISPR ,  増強 ,  ループ ,  増幅