文献

J-GLOBAL ID：202202280259842425   整理番号：22A1025772

肺腺癌の細胞サイクル進行経路変化/非変更患者間のゲノムおよび腫瘍微小環境の差異【JST・京大機械翻訳】

Genomic And Tumor Microenvironment Differences Between Cell Cycle Progression Pathway Altered/Non-Altered Patients With Lung Adenocarcinoma

著者 (10件)： Shan Guangyao (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Bi Guoshu (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Bian Yunyi (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Valeria Besskaya (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zeng Dejun (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhang Huan (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Yao Guangyu (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhang Yi (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Fan Hong (2Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University (Xiamen Branch), Xiamen, China) ,  Zhan Cheng (1Department of Thoracic Surgery, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 12  ページ： 843528  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:癌の特徴として,調節不全細胞周期進行は,肺腺癌(LUAD)の促進と進行において重要な役割を果たす。しかしながら,細胞周期進行経路変化/非変性LUAD患者間のゲノムおよび微小環境の違いは,解明されていない。材料と方法:この研究のデータは,単純なヌクレオチド変異,コピー数変化(CNV),RNA-seq遺伝子発現,miRNA発現,生存および臨床情報を含む癌ゲノムアトラス(TCGA)から得た。さらに,著者らの施設からの34のLUADサンプルを検証コホートとして使用した。差次的発現遺伝子(DEG),濃縮分析,および免疫細胞浸潤を検出した。最後に,LUAD患者における細胞周期関連遺伝子突然変異(CDKN2A,CCND1,CDK4,CCNE1,およびRB1)を予測するためのLASSO-バイナリロジスティック回帰モデルを構築し,さらに著者らの施設からのサンプルでそれを検証した。結果:細胞周期進行経路状態に基づき,LUAD患者を突然変異(n=322)と野生(n=46)群に分けた。野生群と比較して,突然変異群はより高い突然変異負荷とCNVを有した。分析した16684の蛋白質コード遺伝子の中で,302はアップレギュレートされ,354は突然変異群で下方制御された。濃縮分析は,これらのDEGが代謝項目と密接に関連することを示した。22の免疫細胞浸潤分析を実施した後,単球(P<0.01)と樹状細胞(P<0.01)のような5つの免疫細胞の比率は,野生群でより高かった。最後に,LUAD患者における細胞周期進行経路関連遺伝子変異(CDKN2A,CCND1,CDK4,CCNE1,およびRB1)を予測することができるLASSO-Logistic回帰分析によって,細胞周期関連15-署名モデルを作成した。”その結論]は,細胞周期進行経路関連遺伝子突然変異(CDKN2A,CCND1,CDK4,CCNE1,およびRB1)を予測することができた。検証コホートは,このモデルの感度と特異性がそれぞれ0.667と0.929であることを示した。結論:ゲノムおよび微小環境特性は,LUADの細胞周期進行経路変化/非変化患者の間で異なった。著者らの知見は,LUAD患者の個別化治療への新しい洞察を提供する可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  突然変異 ,  *ゲノム ,  *細胞周期 ,  母集団 ,  単球 ,  遺伝子発現 ,  *肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  遺伝子変異
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *肺腺癌 ,  *微小環境 ,  免疫細胞 ,  細胞周期進行 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 細胞周期 ,  肺腺癌 ,  医療情報学 ,  RNA-seq ,  腫瘍微小環境

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

引用文献 (39件)：

• Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin (2021) 71:209-49. doi: doi: 10.3322/caac.21660
• Oser MG, Niederst MJ, Sequist LV, Engelman JA. Transformation From non-Small-Cell Lung Cancer to Small-Cell Lung Cancer: Molecular Drivers and Cells of Origin. Lancet Oncol (2015) 16:e165-e72. doi: doi: 10.1016/S1470-2045(14)71180-5
• Imielinski M, Berger AH, Hammerman PS, Hammerman PS, Hernandez B, Pugh TJ, Hodis E, et al. Mapping the Hallmarks of Lung Adenocarcinoma With Massively Parallel Sequencing. Cell (2012) 150:1107-20. doi: doi: 10.1016/j.cell.2012.08.029
• Miller KD, Nogueira L, Mariotto AB, Rowland JH, Yabroff KR, Alfano CM, et al. Cancer Treatment and Survivorship Statistics, 2019. CA Cancer J Clin (2019) 69:363-85. doi: doi: 10.3322/caac.21565
• Sudhindra A, Ochoa R, Santos ES. Biomarkers, Prediction, and Prognosis in Non-Small-Cell Lung Cancer: A Platform for Personalized Treatment. Clin Lung Cancer (2011) 12:360-8. doi: doi: 10.1016/j.cllc.2011.02.003

タイトルに関連する用語 (7件)： 肺腺癌 ,  細胞サイクル ,  経路 ,  患者 ,  ゲノム ,  腫瘍微小環境 ,  差異