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J-GLOBAL ID：202202280335969092   整理番号：22A0998655

コクサッキーウイルスB群の5型感染ヒト悪性胚横紋筋肉腫細胞株lncRNA発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

LncRNA expression profile in human malignant embryonic rhabdomyosarcoma cell line infected with Coxsackie virus group B type 5

著者 (6件)： Teng Peiying (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500) ,  Li Jing (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500) ,  Shi Yulu (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500) ,  Yang Fan (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500) ,  Ou Xia (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500) ,  Chen Wei (昆明理工大学 医学院,云南 昆明650500)
資料名： Jichuyixue Yulinchuang  (Jichuyixue Yulinchuang)
巻： 42  号： 1  ページ： 68-74  発行年： 2022年 
JST資料番号： C2932A  ISSN： 1001-6325  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:コクサッキーウイルスB群5型(CVB5)がヒト悪性胚横紋筋肉腫細胞株(RD)に感染する差異長鎖非コードRNA(lncRNA)発現プロファイルを探索し、CVB5と宿主間の相互作用の分子メカニズムを研究するための参考を提供する。【方法】CVB5を,24時間感染後24時間,感染多重(MOI)により,総RNAを抽出した。トランスクリプトームシークエンシング技術を用いて、細胞中のlncRNA差次的発現スペクトルを獲得し、クラスター分析、GO分析とKEGG経路濃縮により、差次的発現転写物に対してバイオインフォマティクス分析を行った。同時に、RNAfoldソフトウェアを用いてlncRNAに対して二次構造予測を行った。結果:対照群と比べ、CVB5がRD細胞に感染した後、1754個のmRNAsと508個のlncRNAが上方制御され、3106個のmRNAsと760個のlncRNAが下方制御された。lncRNAの共発現遺伝子は、主に分子構造活性、タンパク質分子結合と体液免疫反応などの生物過程に集中し、lncRNA標的遺伝子は主に嗅覚伝達経路、サイトカイン受容体相互作用と神経活性リガンド受容体相互作用などの経路に関与する。さらに、リアルタイム蛍光定量PCRで検証した7つの差異発現lncRNAはシークエンシングの結果と一致した。結論:CVB5がRD細胞に感染した後、顕著な性lncRNAは免疫関連過程に関与し、lncRNAのCVB5感染における調節作用を十分に理解するために基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  分子構造 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  *感染 ,  ソフトウェア ,  遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 配列解析 ,  バイオインフォマティクス ,  分子機構 ,  共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  腫よう学一般  (GE01000Z)

タイトルに関連する用語 (9件)： コクサッキーウイルス ,  感染 ,  ヒト ,  胚 ,  横紋筋肉腫 ,  細胞株 ,  lncRNA ,  発現 ,  プロファイリング