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J-GLOBAL ID:202202280851930575   整理番号:22A1178866

免疫療法を支援するための膵臓腺癌における5-メチルシトシン(m=5C)調節因子および免疫微小環境の包括的解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of 5-Methylcytosine (m5C) Regulators and the Immune Microenvironment in Pancreatic Adenocarcinoma to Aid Immunotherapy
著者 (15件):
資料名:
巻: 12  ページ: 851766  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7089A  ISSN: 2234-943X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:膵腺癌(PAAD)は,最も悪性の癌の一つであり,予後不良である。重要なRNA修飾として,5-メチルシトシン(m5C)は,PAAD進行を含む腫瘍進行を調節することが報告されている。しかし,PAADにおけるm5C調節因子の包括的解析は不足している。方法:本研究では,Gene Expression Omnibus(GEO),癌ゲノムアトラス(TCGA),国際癌ゲノムコンソーシアム(ICGC),およびArrayExpressデータベースからPAADデータセットを得た。m5C調節因子の発現パターンを分析し,患者をm5C調節因子に基づくコンセンサスクラスタ化に従って異なるm5Cクラスタに分けた。さらに,m5C特異的発現遺伝子(DEG)をLimmaパッケージを用いて測定した。m5C DEGに基づいて,患者をm5C遺伝子クラスターに分けた。さらに,m5C遺伝子シグネチャをm5C DEGから誘導し,定量的指標,m5Cスコアをm5C遺伝子シグネチャから開発した。結果:この研究は,m5CレギュレーターがPAAD患者で異なって発現していることを示した。m5C調節因子とm5C DEGに基づくm5Cクラスターと遺伝子クラスターは免疫細胞浸潤,免疫関連遺伝子と患者生存状態に関連しており,m5C修飾が免疫微小環境を調節することにより部分的にPAAD発生の調節に中心的な役割を果たすことを示した。さらに,定量的指標,m5Cスコアも開発し,一連の免疫関連指標に関連した。さらに,m5Cスコアは,PAAD患者の免疫療法応答と予後を正確に予測した。結論:要約すれば,m5C調節因子は免疫微小環境を調節することによりPAAD発生を調節することを確認した。さらに,定量的指標,m5Cスコアを開発し,免疫療法応答と予後を予測し,調整された免疫療法戦略に適したPAAD患者の同定を支援した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
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分子・遺伝情報処理  ,  遺伝子発現 
引用文献 (75件):
  • Mizrahi JD, Surana R, Valle JW, Shroff RT. Pancreatic Cancer. Lancet (2020) 395(10242):2008-20. doi: doi: 10.1016/S0140-6736(20)30974-0
  • Morrison AH, Byrne KT, Vonderheide RH. Immunotherapy and Prevention of Pancreatic Cancer. Trends Cancer (2018) 4(6):418-28. doi: doi: 10.1016/j.trecan.2018.04.001
  • Karamitopoulou E. Tumour Microenvironment of Pancreatic Cancer: Immune Landscape Is Dictated by Molecular and Histopathological Features. Br J Cancer (2019) 121(1):5-14. doi: doi: 10.1038/s41416-019-0479-5
  • Raskov H, Orhan A, Christensen JP, Gogenur I. Cytotoxic CD8(+) T Cells in Cancer and Cancer Immunotherapy. Br J Cancer (2021) 124(2):359-67. doi: doi: 10.1038/s41416-020-01048-4
  • Tanaka A, Sakaguchi S. Regulatory T Cells in Cancer Immunotherapy. Cell Res (2017) 27(1):109-18. doi: doi: 10.1038/cr.2016.151
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