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J-GLOBAL ID：202202280983444986   整理番号：22A0328849

資源制限環境におけるSARS-CoV-2の点検出に対するリコンビナーゼに基づく等温増幅アッセイの評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of recombinase-based isothermal amplification assays for point-of-need detection of SARS-CoV-2 in resource-limited settings

著者 (14件)： Ghosh Prakash (Emerging Infections and Parasitology Laboratory, NCSD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Chowdhury Rajashree (Emerging Infections and Parasitology Laboratory, NCSD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Hossain Mohammad Enayet (Virology Laboratory, IDD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Hossain Faria (Emerging Infections and Parasitology Laboratory, NCSD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Miah Mojnu (Virology Laboratory, IDD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Rashid Md. Utba (Emerging Infections and Parasitology Laboratory, NCSD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Baker James (Laboratory Science and Services Division, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Rahman Mohammed Ziaur (Virology Laboratory, IDD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Rahman Mustafizur (Virology Laboratory, IDD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Ma Xuejun (Chinese Center for Disease Control and Prevention, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Beijing, 102206, China) ,  Duthie Malcolm S. (HDT Bio Corp, Suite 280, 1616 Eastlake Ave E, Seattle, WA, 98102, USA) ,  Wahed Ahmed Abd El (Institute of Animal Hygiene and Veterinary Public Health, University of Leipzig, An den Tierkliniken 43, D-04103, Leipzig, Germany) ,  Mondal Dinesh (Emerging Infections and Parasitology Laboratory, NCSD, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh) ,  Mondal Dinesh (Laboratory Science and Services Division, International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Dhaka, 1212, Bangladesh)
資料名： International Journal of Infectious Diseases  (International Journal of Infectious Diseases)
巻： 114  ページ： 105-111  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3271A  ISSN： 1201-9712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 診断の解読は,世界中のコロナウイルス病2019(COVID-19)の伝染を含む重要な挑戦の1つである。高価な装置による先進中央研究所へのサンプル移動を含む既存のPCRベースの方法の操作上の複雑性は,資源制限設定におけるそれらの使用を制限する。しかし,等温技術の出現により,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の検出は,分散施設で可能である。本研究では,2つのレコンビナーゼに基づく等温技術,逆転写レコンビナーゼポリメラーゼ増幅(RT-RPA)および逆転写レコンビナーゼ支援増幅(RT-RAA)を,臨床試料におけるSARS-CoV-2の検出に対して評価した。合計76のリアルタイム逆転写PCR(リアルタイムRT-PCR)は,COVID-19症例を確認し,100の陰性対照を,等温法の診断性能を決定するために評価した。本研究は,標的遺伝子がRT-RPAとRT-RAAのRdRPとORF1abであったとき,それぞれ,76.32%(95%信頼区間65.18~85.32%)の感度で,2つの方法の等しく有望な診断精度を明らかにした。RT-RPAにおけるNとRdRPの組合せは,感度85.53%(95%信頼区間75.58~92.55%)でアッセイの精度を高めた。さらに,94.00%から98.00%(95%信頼区間87.40~9.76%)の範囲の各方法について高い特異性が観察された。診断精度を考慮すると,RT-RPAとRT-RAAは,病原体の検出,その疫学,症例管理,およびcurbing伝染の理解のためのポイントオブネジ展開のための適切なアッセイであるように見える。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 感度 ,  遺伝子 ,  診断 ,  病原体 ,  *コロナウイルス科 ,  疫学 ,  性質 ,  逆転写 ,  *レコンビナーゼ ,  RT-PCR法
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  ケースマネージメント ,  診断精度 ,  複雑性 ,  標的遺伝子 ,  実時間 ,  特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  RT-RPA ,  RT-RAA ,  レコンビナーゼ ,  診断 ,  ポイントオブリード

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (8件)： 資源制限 ,  環境 ,  SARS-CoV-2 ,  点検 ,  リコンビナーゼ ,  増幅 ,  アッセイ ,  評価