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J-GLOBAL ID：202202281041990515   整理番号：22A0651808

バイオインフォマティクス解析による骨肉腫における重要な遺伝子と経路の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Key Genes and Pathways in Osteosarcoma by Bioinformatics Analysis

著者 (8件)： Chen Xiujin (Department of Orthopaedic Oncology, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  Zhang Nan (Department of Pathology, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  Zheng Yuanyuan (Geriatric Cardiovascular Department, The Second Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University (Xibei Hospital), Xi’an, Shaanxi Province, China) ,  Tong Zhichao (Department of Orthopaedic Oncology, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  Yang Tuanmin (Department of Orthopaedic Oncology, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  Kang Xin (Department of Sports Medicine, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  He Yan (Department of Magnetic Resonance Imaging, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China) ,  Dong Liang (Department of Cervical Spine Surgery, Hong Hui Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710054 Shaanxi Province, China)
資料名： Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web)  (Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7693A  ISSN： 1748-670X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的.骨肉腫(OS)は,青年における最も原発性骨悪性腫瘍である。OSの治療は大きな進歩を遂げたが,患者の予後は腫瘍浸潤と転移のため不良である。材料と方法。遺伝子発現プロファイルGSE12865を遺伝子発現Omnibusデータベースからダウンロードした。R limmaソフトウェアパッケージを用いて,差次的発現遺伝子(DEG)をスクリーニングした。遺伝子オントロジー,遺伝子およびゲノムの京都エンシクロペディアおよび遺伝子セット濃縮分析に基づき,機能および経路濃縮分析を行った。次に,蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを構築し,相互作用遺伝子の検索のための検索ツールを通してハブ遺伝子をスクリーニングした。【結果】遺伝子発現プロファイルGSE12865を分析することによって,著者らは703のOS関連DEGを得て,それは上方制御された166の遺伝子および下方制御された537の遺伝子を含んだ。DEGは主にリボソーム,細胞接着分子,ユビキチン-ユビキチンリガーゼ活性,およびp53シグナル伝達経路において豊富であった。OSのハブ遺伝子は,PPIネットワーク分析を通して,KDR,CDH5,CD34,CDC42,RBX1,POLR2C,PPP2CA,およびRPS2であった。最後に,GSEA分析は,細胞接着分子,ケモカインシグナル経路,経内皮移動および焦点接着がOSと関係することを示した。結論.本研究では,マイクロアレイ技術とバイオインフォマティクス分析を分析することにより,OSに関するハブ遺伝子と経路を同定し,OSの新しい分子機構を明らかにした。Copyright 2022 Xiujin Chen et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  プログラムパッケージ ,  リボソーム ,  *骨肉腫 ,  ユビキチン ,  遺伝子発現 ,  腫瘍浸潤 ,  ダウンレギュレーション ,  ケモカイン ,  p53タンパク質 ,  バイオチップ
準シソーラス用語： 分子機構 ,  差次的遺伝子発現 ,  マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (30件)：

• A. Misaghi, A. Goldin, M. Awad, A. A. Kulidjian, "Osteosarcoma: a comprehensive review," SICOT-J, vol. 4, pp. 12, 2018.
• G. Ottaviani, N. Jaffe, "The epidemiology of osteosarcoma," Cancer Treatment and Research, vol. 152, pp. 3-13, 2009.
• L. Mirabello, R. J. Troisi, S. A. Savage, "International osteosarcoma incidence patterns in children and adolescents, middle ages and elderly persons," International Journal of Cancer, vol. 125, no. 1, pp. 229-234, 2009.
• J. W. Martin, J. A. Squire, M. Zielenska, "The genetics of osteosarcoma," Sarcoma, vol. 2012, pp. 11, 2012.
• H. T. Ta, C. R. Dass, P. F. M. Choong, D. E. Dunstan, "Osteosarcoma treatment: state of the art," Cancer Metastasis Reviews, vol. 28, no. 1-2, pp. 247-263, 2009.

タイトルに関連する用語 (5件)： バイオインフォマティクス解析 ,  骨肉腫 ,  遺伝子 ,  経路 ,  同定