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J-GLOBAL ID：202202281671487172   整理番号：22A1052851

トランスクリプトミクスとメタゲノム分析の比較はアカザメ(Procambarus clarkii)の成長率に影響する重要な因子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative transcriptomic and metagenomic analyses reveal key factors affecting the growth rate of Red Swamp Crayfish (Procambarus clarkii)

著者 (11件)： Chen Duanduan (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Chen Duanduan (College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Guo Leifeng (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Wang Chen (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Cao Hongzhen (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Mo Wei (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Xin Yunteng (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Zeng Yongqing (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Zeng Yongqing (College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Wang Hui (Aquaculture Research Lab, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China) ,  Wang Hui (College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China)
資料名： Aquaculture Reports  (Aquaculture Reports)
巻： 23  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3063A  ISSN： 2352-5134  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高度に制御された成長条件下でも,赤湿地ザリガニ(Procambarus clarkii)の同胞個体は,しばしば発育を示す。発育不全の原因を解明するために,著者らは,同胞ザリガニの肝膵臓トランスクリプトームと腸内フローラを比較した。個々の変化を調べ,宿主トランスクリプトーム機能による腸内細菌群落機能の会合を調べた。合計60,637,958の単一遺伝子を300,691,028の高品質読取から組み立てた。種々のサイズのザリガニ肝膵臓の発現パターンを比較したとき,497の差次的発現遺伝子(P<0.05)を発見した。KEGGデータベースとGO機能アノテーションを行い,脂肪酸産生に関連する遺伝子に見られる最も有意な濃縮を伴う32の豊富なKEGGシグナル伝達経路を明らかにした。さらに,他の代謝関連酵素(AMS,Gls,およびLps)と免疫関連酵素(Lyz,SOD,およびPpo)の濃縮を,急速に成長する個体をゆっくり成長する個体と比較するとき,さらに発見した。さらに,Proteobacteria,Tenericutes,ActinomycetesおよびCyanoobacteria細菌は,急速に成長する個体のミクロビオームにおいてより一般的であり,ザリガニの微生物叢が速い成長に適応し,代謝遺伝子の発現レベルを調節することによって加速した発達を促進する可能性があることを,発見した。これらの結果は,ザリガニの腸内フローラと成長速度の間の関連に焦点を当てた将来の研究の基礎を築く。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  細菌 ,  酵素 ,  遺伝子 ,  宿主 ,  湿地 ,  ミクロフローラ ,  *ザリガニ類 ,  成長速度 ,  アノテーション ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  *メタゲノム ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Procambarus clarkii ,  遺伝的背景 ,  肝膵臓トランスクリプトーム ,  腸内微生物構造

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトミクス ,  Procambarus ,  成長率 ,  因子