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J-GLOBAL ID：202202281983289233   整理番号：22A1179878

ディジタル空間プロファイリングは潰瘍性大腸炎患者における腸クロム親和性細胞の機能的シフトを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Digital Spatial Profiling Reveals Functional Shift of Enterochromaffin Cell in Patients With Ulcerative Colitis

著者 (23件)： Lyu Dongping (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Lyu Dongping (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Kou Guanjun (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Kou Guanjun (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Shiyang (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Shiyang (3Advanced Medical Research Institute, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Shiyang (4Key Laboratory for Experimental Teratology of Ministry of Education, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Lixiang (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Lixiang (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Lixiang (5Robot Engineering Laboratory for Precise Diagnosis and Therapy of GI Tumor, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Bing (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Bing (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhou Ruchen (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhou Ruchen (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Yang Xiaoxiao (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Yang Xiaoxiao (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Tian Wenyu (3Advanced Medical Research Institute, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Yanqing (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Yanqing (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Yanqing (5Robot Engineering Laboratory for Precise Diagnosis and Therapy of GI Tumor, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Zuo Xiuli (1Department of Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Zuo Xiuli (2Laboratory of Translational Gastroenterology, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China) ,  Zuo Xiuli (5Robot Engineering Laboratory for Precise Diagnosis and Therapy of GI Tumor, Qilu Hospital, Shandong University, Jinan, China)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 10  ページ： 841090  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腸内分泌系の主要な構成要素として,エンテロクロマフィン(EC)細胞は潰瘍性大腸炎(UC)において重要な役割を果たす。しかし,EC細胞の不足は,それらの機能の研究を制限した。この研究では,UCと7人の健康な対照の8人の患者から,結腸鏡生検試料からEC細胞と他の上皮細胞に対するトランスクリプトミクスデータを取得するため,デジタル空間プロファイリングを適用した。差次的発現解析,遺伝子セット濃縮分析,および加重遺伝子共発現ネットワーク分析を行って,差次的に発現した遺伝子と経路および共発現ネットワークを同定した。結果を,免疫蛍光染色および定量的リアルタイムPCRと共に,単一細胞RNA配列決定により得られたオンラインデータセットを用いて検証した。健康な参加者では,10の遺伝子がEC細胞で有意に濃縮され,蛋白質とバイオアミン合成に機能的に集中していた。TPH1,CHGAおよびGCLCを含む17のハブ遺伝子を含む共発現ネットワークをEC細胞において同定した。UC患者では,EC細胞は抗原プロセシングや提示のような新しい免疫学的機能と共に蛋白質合成の増加した能力を獲得したが,化学的感覚は下方制御された。EC細胞におけるCHGBとRGS2の特異的発現は,免疫蛍光染色によって確認した。本結果はヒト結腸におけるEC細胞の転写シグネチャを明らかにした。EC細胞の新しく観察された感覚から分泌および免疫への機能的シフトは,UCにおける中心的な役割を示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  結腸 ,  タンパク質 ,  タンパク質合成 ,  ヒト ,  *患者 ,  生検 ,  遺伝子発現 ,  上皮細胞 ,  免疫染色 ,  EC細胞
準シソーラス用語： 単一細胞 ,  共発現 ,  免疫蛍光染色 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 腸クロム親和性細胞 ,  潰瘍性大腸炎 ,  ディジタル空間プロファイリング ,  クロモグラニンB ,  単一細胞RNA-seq

分類 (4件)： 消化器の疾患  (GH03000W) ,  免疫反応一般  (ED03010T) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (45件)：

• AkibaY., InoueT., KajiI., HigashiyamaM., NarimatsuK., IwamotoK.-i., et al (2015). Short-chain Fatty Acid Sensing in Rat Duodenum. J. Physiol. 593 (3), 585-599. doi: 10.1113/jphysiol.2014.280792
• AlcainoC., KnutsonK. R., TreichelA. J., YildizG., StregeP. R., LindenD. R., et al (2018). A Population of Gut Epithelial Enterochromaffin Cells Is Mechanosensitive and Requires Piezo2 to Convert Force into Serotonin Release. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 115 (32), E7632-E7641. doi: 10.1073/pnas.1804938115
• BartolomucciA., PossentiR., MahataS. K., Fischer-ColbrieR., LohY. P., SaltonS. R. J. (2011). The Extended Granin Family: Structure, Function, and Biomedical Implications. Endocr. Rev. 32 (6), 755-797. doi: 10.1210/er.2010-0027
• BellonoN. W., BayrerJ. R., LeitchD. B., CastroJ., ZhangC., O’DonnellT. A., et al (2017). Enterochromaffin Cells Are Gut Chemosensors that Couple to Sensory Neural Pathways. Cell. 170 (1), 185-198. e16. doi: 10.1016/j.cell.2017.05.034
• BeumerJ., PuschhofJ., Bauzá-MartinezJ., Martínez-SilgadoA., ElmentaiteR., JamesK. R., et al (2020). High-Resolution mRNA and Secretome Atlas of Human Enteroendocrine Cells. Cell. 181 (6), 1291-1306. e19. doi: 10.1016/j.cell.2020.04.036

タイトルに関連する用語 (6件)： ディジタル ,  プロファイリング ,  潰瘍性大腸炎 ,  患者 ,  腸クロム親和性細胞 ,  シフト