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J-GLOBAL ID：202202282956752577   整理番号：22A0100309

SARS-CoV-2に対する抗ウイルス薬としての2D COFへの原子論的洞察【JST・京大機械翻訳】

Atomistic insight into 2D COFs as antiviral agents against SARS-CoV-2

著者 (8件)： Jahromi Ahmad Miri (Computational Biology and Chemistry Group (CBCG), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), Tehran, Iran) ,  Solhjoo Aida (Computational Biology and Chemistry Group (CBCG), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), Tehran, Iran) ,  Solhjoo Aida (Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran) ,  Ghasemi Mehdi (Computational Biology and Chemistry Group (CBCG), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), Tehran, Iran) ,  Ghasemi Mehdi (Department of Petroleum Engineering, Amirkabir University of Technology, Tehran, Iran) ,  Khedri Mohammad (Computational Biology and Chemistry Group (CBCG), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), Tehran, Iran) ,  Maleki Reza (Computational Biology and Chemistry Group (CBCG), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), Tehran, Iran) ,  Tayebi Lobat (Marquette University School of Dentistry, Milwaukee, WI, 53233, USA)
資料名： Materials Chemistry and Physics  (Materials Chemistry and Physics)
巻： 276  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0934A  ISSN： 0254-0584  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： COVID-19の最近の流行は,世界的な健康懸念を提起した。身体における重症急性呼吸器症候群コロナウイルス-2(SARS-CoV-2)活性の予防は,COVID-19パンデミックを克服する非常に有望な方法である。予防法の1つは,ヒト細胞受容体-ACE2とコロナウイルススパイク蛋白質の間の結合プロセスを制約する。検討では,ACE2とスパイク蛋白質の相互作用の低減における共有結合性有機フレームワーク(COF)によるスパイク蛋白質構造の変形の影響を,計算法により検討した。この点に関して,ACE2とスパイク蛋白質の相互作用の原子解析を分子動力学シミュレーションを用いて提供した。最初に,スパイク蛋白質の構造変化だけでなく,結合エネルギーを解析することにより,スパイク蛋白質とともにCOF-78,DAAQ-TFP,およびCOF-OEtを含む3つの異なるCOFの相互作用を調べた。次に,変形後の蛋白質融合を明らかにするため,ACE2と共に変形したスパイク蛋白質の分子間相互作用を評価した。その結果,全ての導入したCOFはスパイク蛋白質を効果的方法で変形させたが,COF-78は蛋白質の分子構造を変化させることによりスパイク蛋白質-ACE2相互作用の予防において最良の性能を示した。実際,ACE2とのCOF-78による変形スパイク蛋白質の相互作用分析は,それらの相互作用が,他の変形蛋白質と比較して,蛋白質の圧縮がより低い水素結合量とともに,最も低いエネルギーの絶対値を有することを示した。さらに,水媒体との高い接触面積とシミュレーション時間中の厳しい変動がCOF-78の正の性能を確認した。本研究では,表面マスクおよび表面消毒に使用できる新しい材料およびCOVID-19防止方法論を紹介した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結合エネルギー ,  シミュレーション ,  水素結合 ,  相互作用 ,  分子間相互作用 ,  分子構造 ,  *抗ウイルス薬 ,  受容体 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  媒質 ,  *二次元
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  アンギオテンシン変換酵素2 ,  スパイク蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  COVID-19 ,  スパイク蛋白質 ,  COF ,  原子間結合 ,  分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 電気化学反応  (CB07050F) ,  塩基,金属酸化物  (CD01030Z)

タイトルに関連する用語 (5件)： SARS-CoV-2 ,  抗ウイルス薬 ,  2D ,  COF ,  洞察