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J-GLOBAL ID：202202283552395379   整理番号：22A1025175

コムギ(Triticum aestivum L.)における塩素チャンネルTaCLC遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と機能的特性化【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Functional Characterization of the Chloride Channel TaCLC Gene Family in Wheat (Triticum aestivum L.)

著者 (8件)： Mao Peijun (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Run Yonghang (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Wang Hanghui (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Han Changdong (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Zhang Lijun (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Zhan Kehui (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Xu Haixia (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Cheng Xiyong (Co-construction State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science, Collaborative Innovation Center of Henan Grain Crops, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 846795  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物では,塩化物チャンネル(CLC)は栄養輸送とストレス耐性の調節のような一連の特異的機能に関与する。コムギTriticum aestivum L.CLC(TaCLC)遺伝子ファミリーは,窒素輸送に関連する可能性のあるアニオンチャンネル/輸送体をコードするために提案されている。それらの役割をより良く理解するために,TaCLCファミリーをスクリーニングし,23のTaCLC遺伝子配列をコムギゲノムデータベースと共にHidden Markovモデルを用いて同定した。得られたファミリーメンバーの遺伝子構造,染色体位置,保存モチーフおよび発現パターンを分析した。系統発生分析は,TaCLCファミリーが2つのサブクラス(IとII)と7つのクラスタ(-a,-c1,-c2,-e,-f1,-f2と-g2)に分けられることを示した。コムギRNA-seqデータベースを用いて,TaCLCファミリーメンバーの発現パターンは誘導性発現型であると決定した。加えて,7つの異なるクラスタからの7つの遺伝子を,それぞれ低窒素ストレスまたは塩ストレス条件下で定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)分析のために選択した。結果は,このファミリーの遺伝子発現レベルが低窒素ストレスと塩ストレスの下で上方制御され,亜科-c由来のTaCLC-c2クラスターの遺伝子を除くことを示した。酵母相補的実験は,TaCLC-a-6AS-1,TaCLC-c1-3AS,およびTaCLC-e-3ALが,NO_3-またはCl-に対するアニオン輸送機能を有し,アニオン感受性表現型の復元において,酵母GEF1変異株YJR040w(Δgef1)の過敏症を補償したことを示した。本研究は,TaCLC遺伝子のさらなる機能的特性化のための理論的基礎を確立し,コムギにおける硝酸態窒素輸送をより良く理解するための初期参照を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  窒素 ,  *遺伝子 ,  酵母 ,  *コムギ ,  ストレス ,  表現型 ,  クラスタ ,  モデル ,  アニオン ,  遺伝子発現 ,  アップレギュレーション ,  *コムギ属
準シソーラス用語： 塩分ストレス ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コムギ(Triticum aestivum L.) ,  CLC ,  遺伝子族 ,  硝酸塩窒素 ,  機能特性評価

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (61件)：

• Abdullah,, FarajiS., MehmoodF., MalikH. M. T., AhmedI., HeidariP., et al (2021). The GASA Gene Family in Cacao (Theobroma cacao, Malvaceae): Genome Wide Identification and Expression Analysis. Agronomy 11 (7), 1425. doi: 10.3390/agronomy11071425
• AppelsR., EversoleK., AppelsR., EversoleK., FeuilletC., KellerB., et al (2018). Shifting the Limits in Wheat Research and Breeding Using a Fully Annotated Reference Genome. Science 361 (6403), 661. doi: 10.1126/science.aar7191
• ChenC., ChenH., ZhangY., ThomasH. R., FrankM. H., HeY., et al (2020). TBtools: An Integrative Toolkit Developed for Interactive Analyses of Big Biological Data. Mol. Plant 13 (8), 1194-1202. doi: 10.1016/j.molp.2020.06.009
• ChengX., LiuX., MaoW., ZhangX., ChenS., ZhanK., et al (2018). Genome-Wide Identification and Analysis of HAK/KUP/KT Potassium Transporters Gene Family in Wheat (Triticum aestivum L.). Int. J. Mol. Sci. 19 (12), 3969. doi: 10.3390/ijms19123969
• De AngeliA., MonachelloD., EphritikhineG., FrachisseJ. M., ThomineS., GambaleF., et al (2006). The Nitrate/Proton Antiporter AtCLCa Mediates Nitrate Accumulation in Plant Vacuoles. Nature 442 (7105), 939-942. doi: 10.1038/nature05013

タイトルに関連する用語 (7件)： コムギ ,  Triticum ,  塩素チャンネル ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  特性化