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J-GLOBAL ID:202202283718061316   整理番号:22A1024420

珪藻Phaeodactylum tricornutumの比較プロテオーム解析は,その卵,紡錘状,および三放射形態型の細胞内および細胞外蛋白質含量への新しい洞察を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Proteomic Analysis of the Diatom Phaeodactylum tricornutum Reveals New Insights Into Intra- and Extra-Cellular Protein Contents of Its Oval, Fusiform, and Triradiate Morphotypes
著者 (13件):
資料名:
巻: 13  ページ: 673113  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7094A  ISSN: 1664-462X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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Phaeodactyllum tricornutumは,3つの主な形態型を示すことができるので,非定型珪藻である。このような多形性は,環境条件に順応するために厳密に調節される元の代謝により可能である。現在,1つの特異的菌株から発行された各形態型の比較に専念した研究は少なく,この形態形成の生理学的意義に関して利用可能な情報はほとんどない。本研究では,P.tricornutum由来の3つの形態型の比較プロテオーム解析を行った。P.tricornutum Pt3株の1つの優勢な形態型(融合,トリラディエートまたは卵形)に高度に富化した培養を用いた。ペアワイズ比較は,参照として用いた紡錘形のものと比べて,卵形(例えば,プリンおよび細胞アミノ酸代謝)およびトリラジエート形態型(例えば,酸化還元および解糖過程)において上方制御および下方制御された生物学的プロセスを強調した。断面解析により,卵形形態型の特定特徴を同定した。本研究からの結果は,卵形細胞が紡錘状およびトリラジ酸細胞と比較して,特異的蛋白質濃縮による明確な代謝を示す,以前のトランスクリプトミクスRNA配列決定観察を確認した。最後に,各形態型のセクレトームの分析も行った。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (4件):
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植物の生化学  ,  酵素生理  ,  物質の代謝  ,  遺伝子発現 
物質索引 (1件):
物質索引
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引用文献 (54件):
  • Abdullahi A. S., Underwood G. J. C., Gretz M. R. (2006). Extracellular matrix assembly in diatoms (Bacillariophyceae). V. Environmental effects on polysaccharide synthesis in the model diatom, Phaeodactylum tricornutum. J. Phycol. 42 363-378. doi: 10.1111/j.1529-8817.2006.00193.x
  • Ait-Mohamed O., Novák Vanclová A. M. G., Joli N., Liang Y., Zhao X., Genovesio A., et al (2020). PhaeoNet: A Holistic RNAseq-Based Portrait of Transcriptional Coordination in the Model Diatom Phaeodactylum tricornutum. Front. Plant Sci. 11:590949. doi: 10.3389/fpls.2020.590949
  • Allen A. E., Laroche J., Maheswari U., Lommer M., Schauer N., Lopez P. J., et al (2008). Whole-cell response of the pennate diatom Phaeodactylum tricornutum to iron starvation. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 105 10438-10443. doi: 10.1073/pnas.0711370105
  • Almagro Armenteros J. J., Tsirigos K. D., Sønderby C. K., Petersen T. N., Winther O., Brunak S., et al (2019). SignalP 5.0 improves signal peptide predictions using deep neural networks. Nat. Biotechnol. 37 420-423. doi: 10.1038/s41587-019-0036-z
  • Annunziata R., Ritter A., Fortunato A. E., Manzotti A., Cheminant-Navarro S., Agier N., et al (2019). bHLH-PAS protein RITMO1 regulates diel biological rhythms in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 116 13137-13142. doi: 10.1073/pnas.1819660116
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