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J-GLOBAL ID：202202284279011577   整理番号：22A1118573

単一核RNA配列は心臓同種移植片血管症における細胞特異的転写プログラムを同定する【JST・京大機械翻訳】

Single-Nuclear RNA-Sequencing Identifies Cell-Specific Transcriptional Programs in Cardiac Allograft Vasculopathy

著者 (8件)： Amancherla K. (Cardiology, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN) ,  Qin J. (Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN) ,  Hulke M. (Masonic Medical Research Institute, Utica, NY) ,  Pfeiffer R. (Masonic Medical Research Institute, Utica, NY) ,  Lindenfeld J. (Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN) ,  Schlendorf K. (Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN) ,  Tucker N. (Masonic Medical Research Institute, Utica, NY) ,  Moslehi J. (University of California, San Francisco, San Francisco, CA)
資料名： Journal of Heart and Lung Transplantation  (Journal of Heart and Lung Transplantation)
巻： 41  号： 4 S  ページ： S150  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3128A  ISSN： 1053-2498  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 心臓同種移植血管障害(CAV)は,心臓移植(HT)後の後期移植片不全と死亡率の主な原因である。現在の治療法はCAVの進行を予防または失速する有効性が限られている。CAV生物学の改善された理解は,新しい治療法の同定に必要である。著者らは,CAVのない3HTレシピエントの右心室から,および重度のCAVを有する3HTレシピエントにおける心臓外植片の時間において,心筋生検によって得たヒト心臓組織上で,単一核RNA配列決定(snRNA-seq)を行った。コホート間の差次的発現遺伝子(DEG)を,有意な遺伝子に対する5%の偽発見率閾値を用いてDESeq2により同定した。38,211の核の教師なしクラスタリングは15の主要な細胞型(Figure A)を同定した。非CAV心臓からの細胞と比較して,重度のCAVを有する心臓からの内皮細胞と線維芽細胞は,炎症,血管新生,および細胞外マトリックス組織(Figure BとC;内皮細胞)に関連した遺伝子と経路に対する濃縮を示した。これらのDEGを薬物性ゲノムと区別することは,新規細胞特異的薬物標的を同定した。ヒト心内膜心筋生検試料からのsnRNA-seqの実行の実現可能性を示し,重症CAV患者に特異的な細胞特異的転写プログラムを同定した。これらのデータは,CAV発生の機構的理解を加速できる大規模研究の基盤となる。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *心臓 ,  生物学 ,  遺伝子 ,  炎症 ,  *細胞 ,  死亡率 ,  *転写【遺伝】 ,  ヒト ,  患者 ,  心臓移植 ,  内皮細胞 ,  *移植片 ,  血管新生 ,  snRNA
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 循環系疾患の外科療法  (GJ05030X)

タイトルに関連する用語 (6件)： 核RNA ,  心臓 ,  同種移植片血管症 ,  細胞 ,  転写 ,  同定