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J-GLOBAL ID：202202285765145645   整理番号：22A0440882

iTReX:単一および併用療法の用量反応プロファイリングデータの対話型探索【JST・京大機械翻訳】

iTReX: Interactive exploration of mono- and combination therapy dose response profiling data

著者 (27件)： ElHarouni Dina (Bioinformatics and Omics Data Analytics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany) ,  ElHarouni Dina (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  ElHarouni Dina (Division of Pediatric Neurooncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  ElHarouni Dina (Faculty of Biosciences, Heidelberg University, Heidelberg, Germany) ,  Berker Yannick (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Berker Yannick (Clinical Cooperation Unit Pediatric Oncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Peterziel Heike (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Peterziel Heike (Clinical Cooperation Unit Pediatric Oncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Gopisetty Apurva (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Gopisetty Apurva (Division of Pediatric Neurooncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Turunen Laura (Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), Helsinki Institute of Life Science (HiLIFE), University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Kreth Sina (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Kreth Sina (Division of Neuroblastoma Genomics, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Stainczyk Sabine A. (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Stainczyk Sabine A. (Division of Neuroblastoma Genomics, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Oehme Ina (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Oehme Ina (Clinical Cooperation Unit Pediatric Oncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Pietiaeinen Vilja (Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), Helsinki Institute of Life Science (HiLIFE), University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Jaeger Natalie (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Jaeger Natalie (Division of Pediatric Neurooncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Witt Olaf (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Witt Olaf (Clinical Cooperation Unit Pediatric Oncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany) ,  Witt Olaf (Department of Pediatric Oncology, Hematology, Immunology and Pulmonology Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Schlesner Matthias (Bioinformatics and Omics Data Analytics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany) ,  Schlesner Matthias (Biomedical Informatics, Data Mining and Data Analytics, Faculty of Applied Computer Science and Medical Faculty, University of Augsburg, Augsburg, Germany) ,  Oppermann Sina (Hopp Children’s Cancer Center (KiTZ), Heidelberg, Germany) ,  Oppermann Sina (Clinical Cooperation Unit Pediatric Oncology, German Cancer Research Center (DKFZ) and German Cancer Consortium (DKTK), Heidelberg, Germany)
資料名： Pharmacological Research  (Pharmacological Research)
巻： 175  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0326B  ISSN： 1043-6618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬物治療に対する腫瘍細胞の感受性と耐性を測定するハイスループットスクリーニング法は,急速に進化している。これらのスクリーニングは,治療応答の新しい予測因子を開発するための腫瘍ゲノム特徴に応答プロファイルを相関させるだけでなく,正確な腫瘍学における治療意思決定のための証拠を追加できる。単一薬剤または併用薬剤効果を評価する最近の分析法は,制限された対称適合設定で用量反応曲線の定量化を可能にする。ここでは,モノ-および併用療法応答の両方の分析に対し,ユーザフレンドリーで,対話型のShiny/RアプリケーションであるiTReXを導入した。応用は,高度な5パラメータ用量反応曲線モデルの積分に基づく薬剤感受性スコア(DSS)の拡張版と,併用療法プロファイリングのための微分DSSに基づく。さらに,iTReXは薬物標的相互作用ネットワークを可視化するモジュールを含み,薬剤性標的とバイオマーカーの同定を可能にするためのトップ治療ヒットと試料オミクス特徴の間のマッチの検出を支持し,iTReXは種々の定量的薬物または治療応答読出し(例えば,ルミネセンス,蛍光顕微鏡)および多重治療戦略(薬物治療,放射線)の分析を可能にする。iTReXを用いて,費用対効果の高い薬物組合せスクリーニング法を検証し,薬物標的相互作用ネットワークに基づく潜在的試料特異的バイオマーカーを同定する応用能力を明らかにした。iTReXウェブアプリケーションはhttps://itrex.kitz-heidelberg.deでアクセス可能である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  意思決定 ,  ネットワーク ,  腫瘍 ,  腫瘍細胞 ,  可視化 ,  ゲノム ,  多重化 ,  薬物療法 ,  応用プログラム ,  *併用療法 ,  スクリーニング ,  バイオマーカー ,  薬剤感受性
準シソーラス用語： オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 治療反応プロファイリングと探査 ,  対話型薬物スクリーン分析 ,  非対称感度スコアリング ,  微分組合せ感度スコアリング ,  個別化医療 ,  薬物標的ネットワーク

分類 (2件)： 腫ようの実験的治療  (GE02040Y) ,  腫ようの薬物療法  (GE03032C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 併用療法 ,  用量 ,  プロファイリング ,  対話型 ,  探索