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J-GLOBAL ID：202202286289615789   整理番号：22A1058223

分光技術と分子シミュレーションの助けによるウシ胸腺DNAとリトナビルの結合特性の研究【JST・京大機械翻訳】

Investigation of binding characteristics of ritonavir with calf thymus DNA with the help of spectroscopic techniques and molecular simulation

著者 (7件)： Kou Song-Bo (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Zhou Kai-Li (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Lin Zhen-Yi (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Lou Yan-Yue (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Wang Bao-Li (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Shi Jie-Hua (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China) ,  Liu Ying-Xin (College of Pharmaceutical Science, Zhejiang University of Technology, Hangzhou, China)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 7  ページ： 2908-2916  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ct-DNAによるHIV/AIDSプロテアーゼ阻害剤であるリトナビル(RTV)の結合挙動を,多重試験技術および理論計算を通して特性化した。所見は,RTV-DNA複合体が,主に従来の水素結合と炭素水素結合ならびに疎水性相互作用(pi-アルキル相互作用)を含む非共有結合相互作用を介して形成されることを明らかにした。RTV-DNA複合体の化学量論と結合定数はそれぞれ298Kで1:1と1.87×103M-1であり,RTVがct-DNAと中程度の親和性を有することを示した。所見はRTVがDNAのマイナーな溝に結合することを確認した。CD実験の結果は,RTVとの結合がDNAの立体配座をわずかに変化させることを示した。しかし,RTVの立体配座はDNAへの結合後に明らかな変化を有し,RTV分子の柔軟性がRTV-DNA複合体の安定化に重要な役割を果たすことを意味した。一方,DFT計算の結果は,RTVとDNA相互作用がRTVのフロンティア分子軌道,双極子モーメントと原子電荷分布の変化を引き起こし,それがDNAに結合したときのRTVの化学的性質を変えることを明らかにした。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  双極子モーメント ,  立体配座 ,  炭素 ,  *DNA【核酸】 ,  *ウシ ,  *胸腺 ,  電荷分布 ,  複合体 ,  結合定数 ,  親和性 ,  プロテイナーゼ阻害剤 ,  密度汎関数法 ,  疎水性相互作用
準シソーラス用語： 非共有結合 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： デオキシリボ核酸 ,  非共有結合相互作用 ,  リトナビル ,  分光法 ,  理論計算

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 分光 ,  分子シミュレーション ,  ウシ ,  胸腺 ,  DNA ,  リトナビル ,  研究