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J-GLOBAL ID：202202286739910893   整理番号：22A1118274

DNAメチル化分析のための全ゲノム重亜硫酸塩配列決定によるプレグラフト化コンディショニング後の真珠カキにおける重要な分子事象の探索【JST・京大機械翻訳】

Exploring crucial molecular events in pearl oyster after pre-grafting conditioning by genome-wide bisulfite sequencing for DNA methylation analysis

著者 (7件)： Gu Zefeng (Fishery College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, 524088, China) ,  Yang Jingmiao (Fishery College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, 524088, China) ,  Yang Min (Fishery College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, 524088, China) ,  Jiao Yu (Fishery College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, 524088, China) ,  Jiao Yu (Pearl Breeding and Processing Engineering Technology Research Centre of Guangdong Province, Zhanjiang, 524088, China) ,  Jiao Yu (Guangdong Science and Innovation Center for Pearl Culture, Zhanjiang, 524088, China) ,  Jiao Yu (Guangdong Provincial Engineering Laboratory for Mariculture Organism Breeding, Zhanjiang, 524088, China)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 123  ページ： 10-19  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プレグラフト条件は,真珠生産中の移植手術からの回復を促進する重要な方法である。本研究では,プレグラフト条件の基礎となる真珠カキPinctada fucata martensiiの分子機構を調べるために,調整の有無で真珠カキから2つのDNAメチロームを構築した。対照(Con)および前移植群(PT)における合計4,594,997および4,930,813メチルCGを検出し,P.f.martensiiにおける全ゲノムメチル化プロファイルおよびメチル化パターンを得た。結果は,プロモーター,特にCpG島に富む領域が,P.f.martensiiの遺伝子機能要素よりまれにメチル化されていることを明らかにした。ConとPTの間の合計51,957の異なるメチル化領域(DMRs)を得て,プロモーターにおける3789のDMRと遺伝子体における16,021を含んだ。遺伝子オントロジーおよび経路濃縮分析に基づいて,これらのDMRsは主に「細胞過程」,「代謝過程」,「Epstein-Barrウイルス感染」および「Fanconi貧血経路」に関連していた。プロモーター領域のメチル化部位はプロモーター活性と転写因子結合と関連する可能性がある。これらの結果は,移植前条件のメカニズムの理解を助け,それによって,移植後の真珠貝の生存率を高めるための調整方法の改善を導くための重要な情報を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  ウイルス感染 ,  *ゲノム ,  *亜硫酸水素塩 ,  生存率 ,  プロモーター領域 ,  アコヤガイ ,  *真珠 ,  転写因子
準シソーラス用語： Pinctada ,  *DNAメチル化 ,  CpGアイランド ,  分子機構 ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Pinctada fucata martensii ,  移植前状態 ,  DNAメチル化 ,  DNAメチローム分析

分類 (1件)： 免疫反応一般  (ED03010T)

タイトルに関連する用語 (11件)： DNAメチル化 ,  分析 ,  ゲノム ,  重亜硫酸塩 ,  グラフト ,  コンディショニング ,  真珠 ,  カキ ,  分子 ,  事象 ,  探索