文献

J-GLOBAL ID：202202286803139800   整理番号：22A0751873

Colon癌患者におけるネクロプシス関連長鎖非コードRNA免疫浸潤の包括的解析および予後の予測【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of Necroptosis-Related Long Noncoding RNA Immune Infiltration and Prediction of Prognosis in Patients With Colon Cancer

著者 (8件)： Liu Li (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Huang Liu (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Chen Wenzheng (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Zhang Guoyang (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Li Yebei (2The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Wu Yukang (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Xiong Jianbo (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Jie Zhigang (1Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 811269  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Colon癌(CC)は世界中で最も高頻度の悪性腫瘍の1つであり,罹患率と死亡率が高い。CCにおいて,壊死症と長い非コードRNA(lncRNA)は極めて重要であるが,その機序は完全には明らかではない。本研究の目的は,CC患者における患者の生存と腫瘍免疫を予測する新しいシグネチャを作成することであった。CCの473人の患者における壊死症関連lncRNAの発現プロファイルを,TCGAデータベースから検索した。差次的発現(DE)遺伝子と最小絶対収縮と選択オペレータ(LASSO)回帰分析に基づく予後モデルに基づくコンセンサスクラスタ分析を実施した。臨床病理学的相関分析,発現差異分析,PCA,TMB,GO分析,KEGG濃縮分析,生存分析,免疫相関分析,臨床治療化合物の予測,およびqRT-PCRも実施した。56の壊死症関連lncRNAsは予後にリンクし,コンセンサスクラスター分析を実施した。異なるサブグループの間で生存,免疫チェックポイント発現,臨床病理学的相関,および腫瘍免疫に実質的な変化があった。6つのlncRNAが発見され,患者はこれらの6つのlncRNAを用いて生成されたリスクスコアに基づいて高リスクと低リスク群に分けられた。低リスク患者の生存期間は,高リスク患者のそれよりかなり長く,これらのlncRNAが生存と直接関連することを示した。リスクスコアは,腫瘍ステージ,浸潤深さ,リンパ節転移および遠隔転移と関連していた。単変量および多変量Cox回帰分析の後,リスクスコアおよび腫瘍病期は,有意であった。癌および代謝関連経路をKEGG分析により濃縮した。免疫浸潤は,腫瘍免疫アッセイにおいて高リスク患者と低リスク患者の間で有意に異なることが示された。8つの化合物をスクリーニングし,qRT-PCRは6つのlncRNAの差次的発現を確認した。全体として,CCにおいて,壊死症関連lncRNAは重要な機能を持ち,CC患者の予後は,これらの6つの壊死症関連lncRNAによって予測することができる。それらは,カスタマイズ癌治療の将来に有用である。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  *浸潤 ,  遺伝子 ,  壊死 ,  死亡率 ,  腫瘍 ,  免疫学的試験 ,  腫瘍転移 ,  *予後 ,  腫瘍進行度 ,  腫瘍免疫 ,  リンパ節転移
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  遠隔転移 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ネクローシス ,  lncRNA ,  結腸癌 ,  予後モデル ,  生物情報学

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (63件)：

• ArnoldM., AbnetC. C., NealeR. E., VignatJ., GiovannucciE. L., McGlynnK. A., et al (2020). Global Burden of 5 Major Types of Gastrointestinal Cancer. Gastroenterology 159 (1), 335-349. e315. doi: 10.1053/j.gastro.2020.02.068
• ArredondoJ., PastorE., SimóV., BeltránM., CastañónC., MagdalenoM. C., et al (2020). Neoadjuvant Chemotherapy in Locally Advanced colon Cancer: a Systematic Review. Tech. Coloproctol. 24 (10), 1001-1015. doi: 10.1007/s10151-020-02289-4
• BalihodzicA., BarthD. A., PrinzF., PichlerM. (2021). Involvement of Long Non-coding RNAs in Glucose Metabolism in Cancer. Cancers (Basel) 13 (5). doi: 10.3390/cancers13050977
• BarikG. K., SahayO., BeheraA., NaikD., KalitaB. (2021). Keep Your Eyes Peeled for Long Noncoding RNAs: Explaining Their Boundless Role in Cancer Metastasis, Drug Resistance, and Clinical Application. Biochim. Biophys. Acta (Bba) - Rev. Cancer 1876 (2), 188612. doi: 10.1016/j.bbcan.2021.188612
• BillerL. H., SchragD. (2021). A Review of the Diagnosis and Treatment of Metastatic Colorectal Cancer-Reply. JAMA 325 (23), 2405. doi: 10.1001/jama.2021.6027

タイトルに関連する用語 (7件)： 癌患者 ,  長鎖非コードRNA ,  免疫 ,  浸潤 ,  解析 ,  予後 ,  予測