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J-GLOBAL ID：202202287447689364   整理番号：22A0987704

S-エクオールのC1三世代全ゲノムシークエンシングと機能遺伝子選別鑑定【JST・京大機械翻訳】

Whole genome sequencing and functional gene screening of SS-equol-producing Clostridium sp.C1

著者 (7件)： Hu Yunfei (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199) ,  Yang Ting (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199) ,  Wang Chunlin (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199) ,  Feng Ran (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199) ,  Chen Huahai (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199) ,  Li Jianglong (湖南海路生物科技有限公司,湖南常徳415400) ,  Yin Yeshi (湖南科技学院化学与生物工程学院,湘南優勢植物資源綜合利用湖南省重点実験室,湖南永州425199)
資料名： Weishengwu Xuebao  (Weishengwu Xuebao)
巻： 62  号： 1  ページ： 333-345  発行年： 2022年 
JST資料番号： C2382A  ISSN： 0001-6209  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】目的は,S-エクオールのS-エクオールを生産し,S-エクオールのS-エクオール変換機構を研究するための参照を提供し,S-エクオールを合成生物学的方法によって生産する新しい遺伝子資源を提供することである。[方法]GridIONシークエンシングプラットフォームを用いて、クロストリジウムC1に対して第3世代全ゲノムシークエンシング、ゲノム組み立てと機能アノテーションなどの分析を行い、C1菌全ゲノムからS-エクオールの生物変換に関与する機能遺伝子をスクリーニングし、同定した。[結果]C1の全ゲノムサイズは3035113bpであり、3166個の遺伝子をコードし、53個のtRNA、15個のrRNA、4個のncRNAと1個の遺伝子アイランドを含む。バイオインフォマティクス分析により、C1-07020遺伝子コーディングタンパク質は既報のLactoccussp.20-92ダイゼインレダクターゼと44.8%のアミノ酸配列類似性と同一の3つの機能保存ドメインを持ち、インビトロ蛋白機能検証が証明された。C1-07020はダイゼインレダクターゼ機能を有する。さらに,C1菌ではS-エクオール菌に似た機能遺伝子クラスターまたはダイゼインレダクターゼ以外の他の機能遺伝子は見られなかった。【結論】S-エクオールの機能的遺伝子をC1で同定し,C1がS-エクオールの特別な生産機構を持つ可能性があり,S-エクオールの新機能遺伝子の更なるマイニングのための基礎データを得た。S-エクオールの生成機構と体外産S-エクオール遺伝子資源の応用に参考を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 符号化 ,  rRNA ,  tRNA ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  *ゲノム ,  生体内変化 ,  Clostridium ,  in vitro実験 ,  遺伝資源 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 非翻訳RNA ,  バイオインフォマティクス ,  ドメイン構造 ,  遺伝子クラスタ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： エクオール ,  C1 ,  世代 ,  ゲノム ,  シークエンシング ,  機能遺伝子 ,  選別 ,  鑑定