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J-GLOBAL ID：202202287547603042   整理番号：22A0907174

研究のライフサイクルを通じた生物医学データ報告のためのBMS-LMオントロジー:データモデルからオントロジーへ【JST・京大機械翻訳】

The BMS-LM ontology for biomedical data reporting throughout the lifecycle of a research study: From data model to ontology

著者 (16件)： Raboudi Amel (Fealinx, 37 rue Adam Ledoux 92400 Courbevoie, France) ,  Raboudi Amel (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Raboudi Amel (Universite de Technologie de Compiegne, Roberval, Compiegne, France) ,  Allanic Marianne (Althenas, Nantes, France) ,  Balvay Daniel (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Herve Pierre-Yves (Fealinx, 37 rue Adam Ledoux 92400 Courbevoie, France) ,  Viel Thomas (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Yoganathan Thulaciga (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Certain Anais (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Hilbey Jacques (Laboratoire d’Informatique Medicale et d’Ingenierie des Connaissances en e-Sante (LIMICS), UMRS_1142, Paris, France) ,  Charlet Jean (Laboratoire d’Informatique Medicale et d’Ingenierie des Connaissances en e-Sante (LIMICS), UMRS_1142, Paris, France) ,  Durupt Alexandre (Universite de Technologie de Compiegne, Roberval, Compiegne, France) ,  Boutinaud Philippe (Fealinx, 37 rue Adam Ledoux 92400 Courbevoie, France) ,  Eynard Benoit (Universite de Technologie de Compiegne, Roberval, Compiegne, France) ,  Tavitian Bertrand (Universite de Paris, PARCC, INSERM, F-75006 Paris, France) ,  Tavitian Bertrand (APHP, Hopital europeen Georges Pompidou, Radiology department, 75015 Paris, France)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 127  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バイオメディカル研究データ再利用と共有は,研究の進展を促進するために必須である。この目的のために,データ生産者は,FAIR(発見可能,アクセス可能,インタオペラブル,再使用可能)ガイドラインのようなオープンデータイニシアティブによって奨励されるように,標準および豊富なメタデータを通してデータ管理および報告を習得する必要がある。これは,データ再ユーザが信頼で共有データを理解し再利用するのを助ける。したがって,専用フレームワークが必要である。生物医学研究ライフサイクルを通しての原産報告は,データを再利用しながら,データの信頼度を増加させる方法として提案されている。バイオメディカル研究-ライフサイクル管理(BMS-LM)データモデルは,いくつかのマルチモーダルイメージング技術のために,起源とライフサイクルトレーサビリティを実装したが,しかし,これは,それを再利用しながら,データ理解に十分でない。実際に,生物医学研究の広い範囲において,知識機構システム(KOS)とも呼ばれる多数のメタデータ源がデータアノテーションのために利用可能である。さらに,データ生産者は,データ報告のための言語用語を含む局所用語またはKOSを使用する。結果は,異なるフォーマットと粒度レベルを有する一連の不均一KOS(局所と公表)である。固有の不均一性を管理するために,セマンティックインタオペラビリティは,研究データ管理(RDM)コミュニティによって奨励される。オントロジーとBFOとDOLCEのようなより具体的にトップオントロジーは,メタデータ意味論を明示的にし,セマンティックインタオペラビリティを強化する。BMS-LMデータモデルとBFOトップオントロジーに基づいて,BioMedical Study-Lifecycle Management(BMS-LM)コアオントロジーを,異種KOS間の意味的インタオペラビリティのための関連フレームワークと共に提案する。それは,4つのオントロジーレベル:トップ/コア/ドメイン/ローカルで作られ,局所と公開されたKOSの間のブリッジを構築することを目的とする。本論文では,BMS-LMデータモデルのコアオントロジーへの変換を詳細に述べる。特定のドメインコンテキストにおける意味的インタオペラビリティの実装を説明し,小動物前臨床研究例を用いて例示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 意味論 ,  言語 ,  信頼度 ,  データ管理 ,  用語 ,  *ライフサイクル ,  生産者 ,  *データモデル ,  インタオペラビリティ ,  アノテーション ,  *オントロジー ,  メタデータ
準シソーラス用語： *生物医学 ,  意味的相互運用性 ,  臨床研究 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 起源 ,  局所用語 ,  データ共有 ,  研究データ管理 ,  データアノテーション ,  異種データ

分類 (1件)： 人工知能  (JE08000Z)

タイトルに関連する用語 (7件)： 研究 ,  ライフサイクル ,  生物医学 ,  データ報告 ,  BMS ,  オントロジー ,  データモデル