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J-GLOBAL ID：202202287614014453   整理番号：22A0751866

新規コンピュータ設計非ヌクレオシド阻害剤の構造研究と構造活性相関およびHIV-1逆転写酵素との相互作用【JST・京大機械翻訳】

Structural Studies and Structure Activity Relationships for Novel Computationally Designed Non-nucleoside Inhibitors and Their Interactions With HIV-1 Reverse Transcriptase

著者 (9件)： Frey Kathleen M. (1Department of Pharmacology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States) ,  Bertoletti Nicole (1Department of Pharmacology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States) ,  Chan Albert H. (2Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  Ippolito Joseph A. (2Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  Bollini Mariela (2Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  Spasov Krasimir A. (1Department of Pharmacology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States) ,  Jorgensen William L. (2Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  Anderson Karen S. (1Department of Pharmacology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States) ,  Anderson Karen S. (3Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 805187  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト免疫不全ウイルスからの逆転写酵素(RT)は抗レトロウイルス療法のための魅力的な薬物標的である。6月2022日は,非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤ネビラピンで解決された最初のヒト免疫不全ウイルス(HIV)RT結晶構造複合体の30分の1回を記した。この構造の放出は,非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NNRTI)の多くのファミリーを設計する機会を開いた。第1のRT-ネビラピン構造へのトリブートの支払いにおいて,HIV RTの非ヌクレオシド阻害剤結合ポケットを標的とするいくつかの化合物クラスを開発した。複合体におけるRTの結晶構造の広範な解析は,構造に基づく薬物設計の反復をインフォームした。7つの付加的錯体の構造を決定し,RTの非ヌクレオシド阻害剤結合ポケット(NNIBP)における残基との鍵となる相互作用を要約するために分析した。抗ウイルスデータおよび分子動力学シミュレーションによる構造を比較する更なる洞察は,ヌクレオチドと非ヌクレオシド結合部位の間の重要な相互作用と動力学を明らかにした。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  *相互作用 ,  *構造活性相関 ,  *ヌクレオシド ,  ヌクレオチド ,  *逆転写酵素 ,  結合部位 ,  複合体 ,  ドラッグデザイン ,  HIV【ウイルス】
準シソーラス用語： *HIV-1逆転写酵素 ,  高活性抗レトロウイルス療法 ,  分子動力学シミュレーション ,  残基 ,  創薬標的 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤 ,  HIV RT ,  構造研究 ,  計算化学 ,  薬物設計

分類 (2件)： 抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (43件)：

• AdamsP. D., AfonineP. V., BunkócziG., ChenV. B., DavisI. W., EcholsN., et al (2010). PHENIX: a Comprehensive Python-Based System for Macromolecular Structure Solution. Acta Crystallogr. D Biol. Cryst. 66 (Pt 2), 213-221. doi: 10.1107/S0907444909052925
• BalamaneM., VargheseV., MelikianG. L., FesselW. J., KatzensteinD. A., ShaferR. W. (2012). Panel of Prototypical Recombinant Infectious Molecular Clones Resistant to Nevirapine, Efavirenz, Etravirine, and Rilpivirine. Antimicrob. Agents Chemother. 56 (8), 4522-4524. doi: 10.1128/AAC.00648-12
• BertolettiN., ChanA. H., SchinaziR. F., YinY. W., AndersonK. S. (2019). Structural Insights into the Recognition of Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors by HIV-1 Reverse Transcriptase: First crystal Structures with Reverse Transcriptase and the Active Triphosphate Forms of Lamivudine and Emtricitabine. Protein Sci. 28 (9), 1664-1675. doi: 10.1002/pro.3681
• BolliniM., DomaoalR. A., ThakurV. V., Gallardo-MaciasR., SpasovK. A., AndersonK. S., et al (2011). Computationally-guided Optimization of a Docking Hit to Yield Catechol Diethers as Potent Anti-HIV Agents. J. Med. Chem. 54 (24), 8582-8591. doi: 10.1021/jm201134m
• BolliniM., CisnerosJ. A., SpasovK. A., AndersonK. S., JorgensenW. L. (2013a). Optimization of Diarylazines as Anti-HIV Agents with Dramatically Enhanced Solubility. Bioorg. Med. Chem. Lett. 23 (18), 5213-5216. doi: 10.1016/j.bmcl.2013.06.091

タイトルに関連する用語 (7件)： コンピュータ設計 ,  ヌクレオシド ,  阻害剤 ,  研究 ,  構造活性相関 ,  HIV-1逆転写酵素 ,  相互作用