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J-GLOBAL ID：202202288205630408   整理番号：22A0431056

Zhikongホタテガイ(Chlamys farreri)における2b-RAD SNPマーカーによる筋肉イメージング形質の遺伝的パラメータの推定【JST・京大機械翻訳】

Estimating genetic parameters of muscle imaging trait with 2b-RAD SNP markers in Zhikong scallop (Chlamys farreri)

著者 (11件)： Wang Yangfan (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Ren Qiang (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Zhao Liang (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Zhao Liang (Liaoning Ocean and Fisheries Science Research Institute, Liaoning 116023, China) ,  Li Moli (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Kong Xiangfu (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Xu Yiqiang (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Hu Xiaoli (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Hu Jingjie (Ocean University China, Sanya Oceanog Inst, Lab Trop Marine Germplasm Res & Breeding Engn, Sanya 572000, China) ,  Bao Zhenmin (MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China) ,  Bao Zhenmin (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266237, China)
資料名： Aquaculture  (Aquaculture)
巻： 549  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0784A  ISSN： 0044-8486  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝的改良は,ホタテガイ産業における高品質で持続的に生産された肉の需要増加に対処する重要なツールである。育種プログラムは遺伝パラメータ,遺伝率,遺伝相関,育種価(BV)などに基づいている。X線技術により,非侵襲的方法で新しい筋肉イメージング形質としてX線ホタテガイ画像において,内転筋面積(AMA)を殻面積(SA)により分割して得た内転筋面積率(AMAP)を用いた。本研究の目的は,1)筋肉イメージング形質AMAPの遺伝パラメーターと,in vivoでのデータを収集するための測定および失敗における低効率を引き起こす解離後の測定および失敗で伝統的に決定されるアダクター筋重量パーセント(AMWP)を推定することであり,2)Zhikongホタテガイ(Chlamys farreri)個体群におけるAMAPおよびAMWPの育種価の推定精度を比較することである。” AMAP”の遺伝子パラメータの推定および(2)in vivoでのデータを収集すること,および(2)Zhikongホタテガイ(Chlamys farreri)個体群におけるAMAPおよびAMWPの育種値の推定精度を比較することである。2b-RAD SNPを,同じ養殖海域で人工的に飼育された個体群からランダムにサンプリングした449の2歳健康および活性Zhikongホタテガイに適用した。全SNP(17,495SNPs MAF>2%)を用いて行ったSNPに基づく遺伝率の推定は,AMAPで0.551(S.E.0.07),AMWPで0.515(S.E.0.08)であった。AMAPとAMWPの染色体様遺伝率は,有意な線形傾向(P=0.02969とP=0.03043)を有する染色体長に対して退行し,筋肉形質への遺伝的寄与がゲノム全体にわたって散乱し,大きな効果をもつ少数の原因遺伝子座よりも小さな影響を有する多くの遺伝子座により駆動されることを意味した。AMAPとAMWP間の表現型と遺伝的相関は0.769(S.E.0.002)と0.917(S.E 0.043)であり,生きたホタテガイの肉の遺伝的改良のために,筋肉成長形質AMWPの置換で画像ベースの形質AMAPを使用できることを示唆した。AMAPとAMWPのゲノム予測精度に及ぼす個体群ゲノム構造(例えば,有効個体群サイズN_e),独立染色体セグメントの数(M_e),SNPマーカー密度,および訓練個体群サイズの影響を,同様に調査した。これらの結果は,ホタテガイの画像ベース形質による育種のための重要な参照情報と方法論基盤を提供するであろう。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  遺伝子 ,  染色体 ,  表現型 ,  *画像処理 ,  ゲノム ,  育種 ,  養殖 ,  *ホタテガイ ,  閉殻筋 ,  個体群 ,  *パラメータ推定 ,  遺伝率 ,  遺伝相関 ,  育種価

著者キーワード (5件)： 遺伝的パラメータ ,  筋肉イメージング特性 ,  SNP ,  ホタテガイ ,  育種の価値

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  動物性水産食品  (FJ13020C) ,  魚類以外の水産動物  (FH02030V)

タイトルに関連する用語 (8件)： ホタテガイ ,  Chlamys ,  SNPマーカー ,  筋肉 ,  イメージング ,  形質 ,  遺伝的パラメータ ,  推定