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J-GLOBAL ID：202202288340366958   整理番号：22A1024980

長毛および正常毛のTianzhu White Yakにおける毛長形質のための候補遺伝的変異のための選択的スキャンポイントの再シークエンシングおよびシグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Resequencing and Signatures of Selective Scans Point to Candidate Genetic Variants for Hair Length Traits in Long-Haired and Normal-Haired Tianzhu White Yak

著者 (20件)： Bao Qi (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Bao Qi (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Ma Xiaoming (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Ma Xiaoming (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Jia Congjun (3Guangdong Meizhou Vocational and Technical College, Meizhou, China) ,  Wu Xiaoyun (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Wu Xiaoyun (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Wu Yi (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Meng Guangyao (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Meng Guangyao (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Bao Pengjia (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Bao Pengjia (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Chu Min (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Chu Min (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Guo Xian (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Guo Xian (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Liang Chunnian (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Liang Chunnian (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China) ,  Yan Ping (1Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, China) ,  Yan Ping (2Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 798076  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Tianzhuホワイトヤクは,中国で純粋な白皮を有するまれな局所ヤク品種である。近年,育種家はTianzhu白ヤクの先頭で長毛が特徴づける長毛個体を発見し,体のこれらの2つの部分の毛の長さと密度は正常なTianzhu白ヤクのものより高い。Tianzhuホワイトヤクにおける毛長の遺伝的機構を解明するために,著者らは,長毛Tianzhu白ヤク(LTWY)(n=10)と正常Tianzhu白ヤク(NTWY)(n=10)の全ゲノムを再配列する。次に,固定指数(F_ST),ΔΨ比,交差個体群複合尤度比(XP-CLR),統合ハプロタイプスコア(iHS),交差個体群拡張ハプロタイプホモ接合性(XP-EHH),および1つの複合法,多重シグナル(DCMS)の脱相関複合体が,長毛形質に関連する遺伝子座と遺伝子を発見するために実行された。5つの単一方法に基づいて,著者らは,それぞれ,染色体6,2つ(FGF5,CFAP299)と4つの遺伝子(ATP8A1,SLC30A9,SHISA3,TMEM33)に関して,長さ0.2と1.1MBの2つのホットスポットを見つけた。2つのホットスポットにおける遺伝子の機能濃縮分析は,Rasシグナル伝達経路,MAPKシグナル伝達経路,PI3K-Aktシグナル伝達経路,およびRap1シグナル伝達経路が毛長差の過程に関与することを明らかにした。さらに,DCMS法はさらに4つの遺伝子(ACOXL,PDPK1,MAGEL2,CDH1)が毛包発生と関連することを見出した。したがって,本研究は,LTWYにおける毛髪成長の機構への新しい遺伝的洞察を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  遺伝子 ,  *毛 ,  成長 ,  ゲノム ,  多重化 ,  育種 ,  複合体 ,  品種 ,  個体群 ,  ホットスポット ,  毛包 ,  ハプロタイプ ,  Rasタンパク質
準シソーラス用語： *配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヤク ,  長毛形質 ,  DCMS ,  選択信号 ,  再シークエンシング

分類 (3件)： 牛  (FD02020Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

引用文献 (71件)：

• AkeyJ. M., RuheA. L., AkeyD. T., WongA. K., ConnellyC. F., MadeoyJ., et al (2010). Tracking Footprints of Artificial Selection in the Dog Genome. Proc. Natl. Acad. Sci. 107 (3), 1160-1165. doi: 10.1073/pnas.0909918107
• Akilli ÖztürkÖ., PakulaH., ChmielowiecJ., QiJ., SteinS., LanL., et al (2015). Gab1 and Mapk Signaling Are Essential in the Hair Cycle and Hair Follicle Stem Cell Quiescence. Cel Rep. 13 (3), 561-572. doi: 10.1016/j.celrep.2015.09.015
• Al-NuaimiY., HardmanJ. A., BíróT., HaslamI. S., PhilpottM. P., TóthB. I., et al (2014). A Meeting of Two Chronobiological Systems: Circadian Proteins Period1 and BMAL1 Modulate the Human Hair Cycle Clock. J. Invest. Dermatol. 134 (3), 610-619. doi: 10.1038/jid.2013.366
• BegM., AbdullahN., ThowfeikF. S., AltorkiN. K., McGrawT. E. (2017). Distinct Akt Phosphorylation States Are Required for Insulin Regulated Glut4 and Glut1-Mediated Glucose Uptake. Elife 6, e26896. doi: 10.7554/eLife.26896
• BoitardS., BoussahaM., CapitanA., RochaD., ServinB. (2016). Uncovering Adaptation from Sequence Data: Lessons from Genome Resequencing of Four Cattle Breeds. Genetics 203 (1), 433-450. doi: 10.1534/genetics.115.181594

タイトルに関連する用語 (7件)： 毛 ,  形質 ,  遺伝的変異 ,  スキャン ,  ポイント ,  シークエンシング ,  シグネチャー