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J-GLOBAL ID：202202288585296919   整理番号：22A1178274

Boehmeria nivea(L.)GaudichにおけるWRKY耐性遺伝子ファミリーの解析:二次細胞壁肥厚とカドミウムストレスのクロストーク機構【JST・京大機械翻訳】

Analysis of WRKY Resistance Gene Family in Boehmeria nivea (L.) Gaudich: Crosstalk Mechanisms of Secondary Cell Wall Thickening and Cadmium Stress

著者 (11件)： Feng Xinkang (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Abubakar Aminu Shehu (Department of Agronomy, Bayero University Kano, Kano, Nigeria) ,  Yu Chunming (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Zhu Aiguo (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Chen Jikang (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Chen Kunmei (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Gao Gang (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Wang Xiaofei (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Mou Pan (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Shao Deyi (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China) ,  Chen Ping (Institute of Bast Fiber Crops, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Changsha, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 812988  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ラミーの全部で60のWRKYファミリー遺伝子をラミーにおいて同定した。遺伝子は,種で14の染色体に不均等に分布し,遠位テロメア領域で高濃度(72%)であった。系統発生解析は,これらの遺伝子を7つの異なるサブファミリー群:I,II(a,b,c,d,e)およびIIIに配置し,グループIIcはヘプタペット配列(WRKYGKK)の変異体のみを含んだ。セグメント重複事象(41.7%)がBnGWRKY進化の主な駆動因子であることが分かった。遺伝子のうち38はArabidopsis thaliana,Cannabis sativa,Oryza sativaおよびZea mays由来のWRKY遺伝子と共線関係を示した。ストレスとホルモン応答シス作用要素の数と密度は,豊富なAREと稀なLTRシス作用要素を有する他の要素よりも比較的高く,ラミーの自然環境への長期適応性を示した。WRKY標的遺伝子のGOおよびKEGG濃縮分析は,刺激,免疫系過程,輸送体蛋白質活性,および抗酸化活性へのそれらの関与を明らかにした。発現解析により,ほとんどのWRKYはカドミウムストレスにより活性化され,特にBnGWRKY2,BnGWRKY15,BnGWRKY20,BnGWRKY50及びBnGWRKY58であった。トランスクリプトーム,オルソログ遺伝子関係およびqPCR結果を組み合わせて,二次細胞壁肥厚とCd2+ストレスの間のクロストーク機構におけるBnGWRKY50およびBnGWRKY58の関与の可能性を確立した。これはラミー二次壁発達とカドミウムストレス応答におけるBnGWRKY蛋白質の役割に情報を提供し,ラミーの改良の基礎として役立つ。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カドミウム ,  トウモロコシ ,  *遺伝子 ,  *ストレス ,  タンパク質 ,  ホルモン ,  系統発生 ,  *増生 ,  テロメア ,  Arabidopsis ,  *クロストーク ,  トランスクリプトーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  *WRKY蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ラミー ,  WRKY転写因子 ,  発現プロファイル ,  カドミウムストレス ,  GO ,  KEGG ,  クロストーク

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (61件)：

• Abubakar A. S., Feng X., Gao G., Yu C., Chen J., Chen K., et al (2022). Genome wide characterization of R2R3 MYB transcription factor from Apocynum venetum revealed potential stress tolerance and flavonoid biosynthesis genes. Genomics 114:110275. doi: 10.1016/j.ygeno.2022.110275
• An X., Chen J., Zhang J., Liao Y., Dai L., Wang B., et al (2015). Transcriptome profiling and identification of transcription factors in ramie (Boehmeria nivea L. Gaud) in response to PEG treatment, using illumina paired-end sequencing technology. Int. J. Mol. Sci. 16 3493-3511. doi: 10.3390/ijms16023493
• Bailey T. L., Boden M., Buske F. A., Frith M., Grant C. E., Clementi L., et al (2009). MEME SUITE: tools for motif discovery and searching. Nucleic Acids Res. 37 W202-W208. doi: 10.1093/nar/gkp335
• Berriri S., Garcia A. V., FreiditFrey N., Rozhon W., Pateyron S., Leonhardt N., et al (2012). Constitutively active mitogen-activated protein kinase versions reveal functions of Arabidopsis MPK4 in pathogen defense signaling. Plant Cell 24 4281-4293. doi: 10.1105/tpc.112.101253
• Bu Y., Takano T., Liu S. (2019). The role of ammonium transporter (AMT) against salt stress in plants. Plant Signal. Behav. 14:1625696. doi: 10.1080/15592324.2019.1625696

タイトルに関連する用語 (10件)： Boehmeria ,  WRKY ,  耐性遺伝子 ,  ファミリー ,  解析 ,  二次細胞壁 ,  肥厚 ,  カドミウム ,  ストレス ,  クロストーク