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J-GLOBAL ID：202202288650860685   整理番号：22A0998888

MAGIC集団に基づくイネのカドミウム含有量の全ゲノム関連分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Association Analysis of Cadmium Content in Rice Based on MAGIC Population

著者 (9件)： Dong Zheng (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Wang Yamei (中国農業科学院 農業基因組研究所, 深zhen 518120) ,  Li Yongchao (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Xiong Haibo (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Xue Canhui (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125) ,  Pan Xiaowu (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Liu Wenqiang (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Wei Xiucai (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125) ,  Li Xiaoxiang (湖南省農業科学院 水稻研究所, 長沙 410125;農業部長江中下游xian稻遺伝育種重点実験室, 長沙 410125)
資料名： Zhongguo Shuidao Kexue  (Zhongguo Shuidao Kexue)
巻： 36  号： 1  ページ： 35-42  発行年： 2022年 
JST資料番号： C2254A  ISSN： 1001-7216  CODEN： ZSKHBX  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]イネのMAGIC-Hei(Multi-parentadvancedgenerationinter-cross)群体に基づき、多環境下でカドミウム含有量に関連する新しい遺伝子座/遺伝子をマイニングする。また、低カドミウムの対立遺伝子を含む優良な株を選別し、低カドミウム蓄積品種を育成するために、新しい遺伝子と生殖質資源を提供した。[方法]8つの親由来のMAGIC群を2017、2018、2019と20年に湖南省長沙に栽培し、イネのカドミウム含有量の表現型テスト分析を行った。GBS(genotypingbysequencing)を用いてゲノムシークエンシングを簡略化し、遺伝子型データを獲得し、イネのカドミウム含有量に対して全ゲノム関連分析(genome-wideassociationanalysis)を行った。GWASは,QTL遺伝子座を発掘し,その遺伝的機構を解析した。[結果]14のカドミウム蓄積に関連するQTL遺伝子座を検出し、第8染色体以外に、その他の11の染色体に分布があった。そのうち、6つの部位は既報告遺伝子と一致し、8つは新たな発見部位であった。また、この8つの遺伝子座は第2、4、7、9と12の染色体に分布し、いずれも2つとそれ以上の環境で検出でき、効果は比較的に安定であり、次の精密定位と機能研究に用いることができる。遺伝子アノテーションと遺伝子発現分析結果を結合して、LOC_Os02g37160、LOC_Os02g49560、LOC_Os04g39010とLOC_Os06g46310はカドミウム含有量関連遺伝子座候補遺伝子であると推測した。これらの遺伝子は重金属輸送と蓄積などの機能に関連する。また、著者らは10個の有利な対立遺伝子を携帯する優れた株を選別し、低カドミウム蓄積水稲材料の創製に用いることができる。[結論]8つの水稲のカドミウム蓄積相関性形質のQTL遺伝子座と低カドミウムの優良な材料が発掘され、カドミウム蓄積に関連する遺伝研究と分子マーカーを用いて、低カドミウム蓄積品種を育成するにはある程度の意義がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カドミウム ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  *イネ ,  遺伝子座 ,  品種 ,  対立遺伝子 ,  水稲 ,  遺伝子発現 ,  アノテーション ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 配列解析 ,  候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 稲作  (FC03020C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 集団 ,  イネ ,  カドミウム ,  含有量 ,  ゲノム ,  分析