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J-GLOBAL ID:202202288658839033   整理番号:22A0568600

太平洋白エビ(Litopenaeus vannamei)における低塩分および成長関連形質のための遺伝的連鎖地図,QTLマッピングの構築と候補遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Construction of a genetic linkage map, QTLs mapping for low salinity and growth-related traits and identification of the candidate genes in Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei)
著者 (20件):
資料名:
巻: 22  ページ: Null  発行年: 2022年 
JST資料番号: W3063A  ISSN: 2352-5134  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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低塩分耐性と成長は,低塩分水を有する地域におけるエビの重要な経済的形質である。本研究では,太平洋白エビ(Litopenaeus vannamei)のF1完全sibファミリーを「半方向性交雑」法により得て,2親と146子孫を二重消化制限部位関連DNA配列決定技術(ddRAD-Seq)を用いて遺伝子型を決定した。合計3335の高品質マーカーを同定し,遺伝的連鎖地図を構築するために使用した。この遺伝地図は48の連鎖群(LG)から成り,全地図長は1.186cMの平均マーカー間隔を持つ3954.462中心体(cM)であった。低塩分耐性のための3つの量的形質遺伝子座(QTLs)と成長のための3つのQTL(体重)を,制限対数確率(LOD)スコア≧2.50の条件下で検出した。L.vannameiおよび関連アノテーションのゲノムの支援により,3つの潜在的成長関連遺伝子(sob,TJP1およびZBTB24)および3つの低塩分応答候補遺伝子(Rnf168,CNOT2およびRPB3)をゲノム足場から同定した。さらに,qPCRの結果は,3つの候補遺伝子の発現レベルが低塩分ストレスによって有意に影響され,それらが低塩分ストレスにおいておそらく重要な役割を果たすことを示した。ここでは,L.vannameiの遺伝的マッピングにおける低塩分耐性QTLのマッピングの最初の報告である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子の構造と化学 

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