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J-GLOBAL ID：202202289089456238   整理番号：22A1024976

LYPD3,急性骨髄性白血病に対する新規バイオマーカーおよび治療標的【JST・京大機械翻訳】

LYPD3, a New Biomarker and Therapeutic Target for Acute Myelogenous Leukemia

著者 (5件)： Hu Tingting (1Department of Pediatrics, Third Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhang Yingjie (2College of Biology, Hunan University, Changsha, China) ,  Yang Tianqing (1Department of Pediatrics, Third Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  He Qingnan (1Department of Pediatrics, Third Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhao Mingyi (1Department of Pediatrics, Third Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 795820  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:急性骨髄性白血病(AML)は,最も高い小児死亡率と比較的予後不良の院内である。C4.4A(LYPD3)は腫瘍形成性で高グリコシル化細胞表面蛋白質であり,固形腫瘍における発癌効果と関連していることが証明されているが,血液学的腫瘍は報告されていない。AMLの発生および発生の調節におけるLYPD3の分子機構を調べ,治療および予後に関連するマーカーのスクリーニングのための研究基礎を提供する。【方法】510サンプルのRNA配列(RNA-seq)とmRNA発現プロファイルに関するデータセットを,癌ゲノムAtlasプログラム/遺伝子型-Tissue発現(Tcga-gtex)から10月2021日に得て,それは173のAML腫瘍組織サンプルと337の正常血液サンプルに関する情報を含んだ。差次的発現,Cox回帰モデルに基づく予後遺伝子の同定,およびLASSO回帰を分析した。より良い検証のために,低分子干渉RNA(siRNA),細胞増殖アッセイ,およびウェスタンブロットによって媒介された遺伝子ノックダウンを含む実験を,予備成形した。LYPD3が,遺伝子セット濃縮分析(GSEA)によりAMLの病因と予後に影響を及ぼす可能性のある関連経路を検討した。結果:合計11,490の差次的発現遺伝子(DEG)を同定した。それらの中で,4,164の遺伝子が上方制御され,7,756の遺伝子が下方制御された。単変量Cox回帰分析およびLASSO回帰分析は,LYPD3,DNAJC8および他の遺伝子を含む28の遺伝子が全生存(OS)と関連することを見出した。多変量Cox分析の後,AML(p<0.05)に悪い影響を有するLYPD3を含むAMLにおいて,合計10の遺伝子はOSと有意に相関していた。実験結果は上記の結論を支持した。E2Fシグナル伝達経路,p53シグナル伝達経路,およびPI3K_AKTシグナル伝達経路を含む25の経路を同定し,それは,GSEAによって高いLYPD3発現(p<0.05)を有するAMLサンプルにおいて有意にアップレギュレートされた。さらに,実験の結果は,LYPD3がp53シグナル伝達経路または/およびPI3K/AKTシグナル伝達経路を介してAMLの発生に関与することを示唆した。結論:本研究は,LYPD3の発現がAMLで上昇し,それは不良な臨床的特徴と予後と相関することを証明した。加えて,LYPD3は,p53または/およびPI3K/AKTシグナリング経路を介しAMLの発生に関与する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  細胞増殖 ,  子供 ,  予後 ,  グリコシル化 ,  回帰モデル ,  遺伝子発現 ,  *バイオマーカー ,  病因 ,  *急性骨髄性白血病 ,  p53タンパク質
準シソーラス用語： 予後不良 ,  mRNA発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 急性骨髄性白血病 ,  COX ,  LASSO ,  LYPD3 ,  予後不良 ,  p53 ,  PI3K/AKT ,  GSEA

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (52件)：

• AcarM., Jafar-NejadH., TakeuchiH., RajanA., IbraniD., RanaN. A., et al (2008). Rumi Is a CAP10 Domain Glycosyltransferase that Modifies Notch and Is Required for Notch Signaling. Cell 132 (2), 247-258. doi: 10.1016/j.cell.2007.12.016
• BarbosaK., LiS., AdamsP. D., DeshpandeA. J. (2019). The Role of TP53 in Acute Myeloid Leukemia: Challenges and Opportunities. Genes Chromosomes Cancer 58 (12), 875-888. doi: 10.1002/gcc.22796
• Cancer Genome Atlas Research NetworkLeyT. J., MillerC., DingL., RaphaelB. J., MungallA. J., RobertsonA., et al (2013). Genomic and Epigenomic Landscapes of Adult De Novo Acute Myeloid Leukemia. N. Engl. J. Med. 368 (22), 2059-2074. doi: 10.1056/NEJMoa1301689
• CastagnolaE., RossiM. R., CesaroS., LivadiottiS., GiacchinoM., ZanazzoG., et al (2010). Incidence of Bacteremias and Invasive Mycoses in Children with Acute Non-lymphoblastic Leukemia: Results from a Multi-center Italian Study. Pediatr. Blood Cancer 55 (6), 1103-1107. doi: 10.1002/pbc.22750
• ChauhanS. C., SinghA. P., RuizF., JohanssonS. L., JainM., SmithL. M., et al (2006). Aberrant Expression of MUC4 in Ovarian Carcinoma: Diagnostic Significance Alone and in Combination with MUC1 and MUC16 (CA125). Mod. Pathol. 19 (10), 1386-1394. doi: 10.1038/modpathol.3800646

タイトルに関連する用語 (3件)： 急性骨髄性白血病 ,  バイオマーカー ,  治療標的