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J-GLOBAL ID：202202289571456833   整理番号：22A1022939

卵胞発育におけるホヤペプチド,同族受容体,およびそれらの関連役割の同定に関するオミクス研究【JST・京大機械翻訳】

Omics Studies for the Identification of Ascidian Peptides, Cognate Receptors, and Their Relevant Roles in Ovarian Follicular Development

著者 (7件)： Kawada Tsuyoshi (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Osugi Tomohiro (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Matsubara Shin (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Sakai Tsubasa (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Shiraishi Akira (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Yamamoto Tatsuya (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan) ,  Satake Honoo (Bioorganic Research Institute, Suntory Foundation for Life Sciences, Kyoto, Japan)
資料名： Frontiers in Endocrinology (Web)  (Frontiers in Endocrinology (Web))
巻： 13  ページ： 858885  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7068A  ISSN： 1664-2392  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Omics研究は遺伝子発現のゲノムとプロファイルの解明に寄与する。ホヤCiona intestinalis A型(Ciona robusta)において,質量分析(MS)に基づくペプチド学研究は,典型的な脊椎動物神経ペプチドおよび視床下部ペプチドホルモンのCiona相同体と同様に多数のCiona特異的(非相同)神経ペプチドを検出した。これらのペプチドに対する同族G蛋白質共役受容体(GPCR)に対するCandidatesは,Cionaトランスクリプトームにおいて2つの方法で見出されている。最初に,脊椎動物対応物のCiona相同GPCRを同族トランスクリプトームの配列相同性検索により検出した。第2に,トランスクリプトーム由来GPCR候補を,Ciona相同ペプチドとGPCR間だけでなく,新規CionaペプチドとGPCR間の相互作用の機械学習に基づく系統的予測に用いた。これらのデータは,最終的に種々のCionaペプチド-GPCR相互作用の実験的証拠をもたらした。野生型とCionaバソプレシン(CiVP)遺伝子編集Cionaの間の比較トランスクリプトミクスは,卵巣卵胞発達と全身成長におけるCiVPの生物学的機能への手がかりを提供する。さらに,Cionaタキキニンおよびシオニン(Ciona colecystokinホモログ)のようなペプチドで処理した卵胞のトランスクリプトームは,Ciona卵胞成長,成熟および排卵に対する重要な調節遺伝子を明らかにし,最終的にこれらの生物学的事象の根底にある必須および新規分子機構の検証に導いた。これらの知見は,人工知能および単一細胞技術と組み合わせたオミクス研究が,ホヤの神経,神経内分泌および内分泌系,および脊索動物を通してのペプチド作動性調節ネットワークの分子的および機能的進化および多様性を,より詳細に調べるための道を開くことを示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  相互作用 ,  *ペプチド ,  *受容体 ,  脊椎動物 ,  *卵胞 ,  生物活性 ,  神経ペプチド ,  ユウレイボヤ属 ,  遺伝子発現 ,  野生型 ,  トランスクリプトーム ,  カタユウレイボヤ
準シソーラス用語： 分子機構 ,  *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ホヤ ,  Ciona intestinalis ,  ペプチドミクス ,  トランスクリプトーム ,  ペプチド ,  受容体

分類 (2件)： 動物の生化学  (EJ01050P) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (54件)：

• Delsuc F, Brinkmann H, Chourrout D, Philippe H. Tunicates and Not Cephalochordates Are the Closest Living Relatives of Vertebrates. Nature (2006) 439:965-8. doi: doi: 10.1038/nature04336
• Denoeud F, Henriet S, Mungpakdee S, Aury JM, Da Silva C, Brinkmann H, et al. Plasticity of Animal Genome Architecture Unmasked by Rapid Evolution of a Pelagic Tunicate. Science (2010) 330:1381-5. doi: doi: 10.1126/science.1194167
• Satoh N, Rokhsar D, Nishikawa T. Chordate Evolution and the Three-Phylum System. Proc Biol Sci (2014) 281:20141729. doi: doi: 10.1098/rspb.2014.1729
• Dehal P, Satou Y, Campbell RK, Chapman J, Degnan B, De Tomaso A, et al. The Draft Genome of Ciona Intestinalis: Insights Into Chordate and Vertebrate Origins. Science (2002) 298:2157-67. doi: doi: 10.1126/science.1080049
• Satou Y, Kawashima T, Shoguchi E, Nakayama A, Satoh N. An Integrated Database of the Ascidian, Ciona Intestinalis: Towards Functional Genomics. Zoolog Sci (2005) 22:837-43. doi: doi: 10.2108/zsj.22.837

タイトルに関連する用語 (8件)： 卵胞発育 ,  ホヤ ,  ペプチド ,  受容体 ,  役割 ,  同定 ,  オミクス ,  研究