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J-GLOBAL ID：202202289625400736   整理番号：22A1058165

SARS-CoV2の3-キモトリプシンとパパイン様プロテアーゼの強力な阻害剤としてのフィトケミカルのスクリーニング:COVID-19戦闘へのin silicoアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Screening of phytochemicals as potent inhibitor of 3-chymotrypsin and papain-like proteases of SARS-CoV2: an in silico approach to combat COVID-19

著者 (3件)： Swargiary Ananta (Department of Zoology, Bodoland University, Kokrajhar, Assam, India) ,  Mahmud Shafi (Microbiology Laboratory, Bioinformatics Division, Genetic Engineering and Biotechnology, University of Rajshahi, Rajshahi, Bangladesh) ,  Saleh Md. Abu (Microbiology Laboratory, Bioinformatics Division, Genetic Engineering and Biotechnology, University of Rajshahi, Rajshahi, Bangladesh)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 5  ページ： 2067-2081  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国,武漢市から出現したCOVID-19とその原因生物SARS-CoV2は,世界を麻痺している。臨床的に承認された薬剤なしで,世界的な健康システムは,効果的な治療手段を見つけるのに苦労している。この重要な接合部において,植物由来化合物のスクリーニングは,COVID-19と戦うための有効な戦略であるかもしれない。本研究では,in-silico技術を用いてSARS-CoV2の3-Chymoトリプシン様(3CLpro)とPapain様プロテアーゼ(PLpro)との植物化合物の結合親和性を調べた。蛋白質に対する結合親和性について,合計32の抗プロテアーゼ植物化合物を調べた。ドッキングはAutodock Vinaで行った。最良のリガンドの薬理団記述子を,配位子Scoutを使用して研究した。アポ蛋白質及びリガンド結合複合体の分子動力学(MD)シミュレーションをYASARAソフトウェアで行った。植物化合物の薬物様特性を,ADMETlabを用いて研究した。32の植物化学物質のうち,アメントフラボンとガロカテキンガラートは,3CLpro(-9.4kcal/mol)とPLpro(-8.8kcal/mol)に最良の結合親和性を示した。サビニン,テアフラビン-3,3-ジガラート,およびカジノール-Aのような植物化学物質も強い親和性を示した。MDシミュレーションは,減少した表面積およびより高い安定性を有する蛋白質におけるリガンド誘導配座転移を明らかにした。蛋白質及びリガンドのRMSD/Fは蛋白質の安定性を示し,両蛋白質におけるリガンドの効果的結合を示唆した。アメントフラボンとガロカテキンガラートは,有望な薬物様特性を持っている。本研究は,Amentoフラボンとガロカテキンガラートが,3CLproとPLpro蛋白質の潜在的阻害剤とSARS-CoV2のための有効な薬物候補であることを示唆する。しかし,in silico研究の知見は,正確な作用様式を確立するためのin vivo研究により支持する必要がある。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドッキング ,  配座転移 ,  *キモトリプシン ,  タンパク質 ,  *トリプシン ,  *パパイン ,  複合体 ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  ソフトウェア ,  親和性 ,  薬理学 ,  *スクリーニング ,  *植物性化学物質
準シソーラス用語： *in silico ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 植物化合物 ,  3CLpro ,  PLPRO ,  SARS-CoV2 ,  ドッキング

分類 (3件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O)

タイトルに関連する用語 (8件)： キモトリプシン ,  パパイン ,  プロテアーゼ ,  阻害剤 ,  フィトケミカル ,  スクリーニング ,  COVID-19 ,  戦闘