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J-GLOBAL ID:202202289632955580   整理番号:22A1177480

小胞体ストレスはBKポリオーマウイルス関連腎症における腎尿細管液胞化を仲介する【JST・京大機械翻訳】

Endoplasmic Reticulum Stress Mediates Renal Tubular Vacuolation in BK Polyomavirus-Associated Nephropathy
著者 (12件):
資料名:
巻: 13  ページ: 834187  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7068A  ISSN: 1664-2392  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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目的:この研究は,BKポリオーマウイルス(BKPyV)により生じる細胞質空胞化の分子機構を検討し,薬剤再精製に対する可能性のある標的を探索することを目的にした。【方法】BKポリオーマウイルス関連腎症(BKPyVAN)の形態学的特徴を,光学顕微鏡と電子顕微鏡の下で研究した。マイクロアレイデータセットGSE75693,GSE47199,およびGSE72925をComBatによって統合し,差次的発現遺伝子(DEG)をlimmaを用いて分析した。さらに,GenCLiP2.0から得られた小胞体(ER)関連遺伝子はDEGと交差した。GOとKEGG濃縮経路は,RパッケージクラスタProfilerによって交差遺伝子によって実行した。BKPyVANレシピエントからの単一細胞RNA配列決定(scRNA-seq)を,遺伝子セット変異分析(GSVA)のための対照として遺伝子発現Omnibus(GEO)からダウンロードしたデータセット(GSE140989)で分析した。薬剤誘発性ERSマウスモデルからの腎臓切片の免疫組織化学と電子顕微鏡を,ERSと尿細管空胞化の関連を調査するために実行した。交差遺伝子の蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを構築し,ハブ標的を同定した。AutoDockを用いて,ハブ遺伝子を潜在的に標的化する食品医薬品局(FDA)承認薬をスクリーニングした。結果:光学顕微鏡および電子顕微鏡は,BKPyV感染腎尿細管細胞において明らかな核内封入体,液胞およびウイルス粒子を示した。トランスクリプトーム分析は,BKPyVANと安定な移植腎臓の試料間で629のDEGを明らかにし,そのうち16はER関連遺伝子であった。交差遺伝子によるGO分析はERS関連経路が有意に関与し,KEGG分析はMAPK,Toll様受容体及びケモカインシグナル伝達経路の顕著な濃縮を示した。近位尿細管のGSVA分析は,同様の経路濃縮を明らかにした。ERSマウスモデルからの腎臓の電子顕微鏡画像は,免疫組織化学により検証されたERSマーカーの顕著な活性化を伴う明らかな尿細管空胞化を示した。さらに,DDIT3はPPI分析に基づくハブ遺伝子として同定された,そして,ZINCOOOOO1531009(リセドロネート)はDDIT3のための潜在的薬物であると示された。結論:ERSは,BKPyVANレシピエントにおける尿細管細胞質空胞化に関与した。リセドロネートは,DDIT3を標的化することにより,BKPyVANの可能性のある薬剤としてスクリーニングした。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
感染症・寄生虫症一般  ,  遺伝子発現  ,  先天性疾患・奇形一般 
引用文献 (57件):
  • Nilsson J, Miyazaki N, Xing L, Wu B, Hammar L, Li TC, et al. Structure and Assembly of a T=1 Virus-Like Particle in BK Polyomavirus. J Virol (2005) 79(9):5337-45. doi: doi: 10.1128/JVI.79.9.5337-5345.2005
  • Stolt A, Sasnauskas K, Koskela P, Lehtinen M, Dillner J. Seroepidemiology of the Human Polyomaviruses. J Gen Virol (2003) 84(Pt 6):1499-1504. doi: doi: 10.1099/vir.0.18842-0
  • Goudsmit J, Wertheim-van Dillen P, van Strien A, van der Noordaa J. The Role of BK Polyomavirus in Acute Respiratory Tract Disease and the Presence of BKPyV DNA in Tonsils. J Med Virol (1982) 10(2):91-9. doi: doi: 10.1002/jmv.1890100203
  • Portolani M, Piani M, Gazzanelli G, Borgatti M, Bartoletti A, Grossi MP, et al. Restricted Replication of BK Polyomavirus in Human Lymphocytes. Microbiologica (1985) 8(1):59-66. doi: 10.1002/jmv.1890100203
  • Hirsch HH, Brennan DC, Drachenberg CB, Ginevri F, Gordon J, Limaye AP, et al. Polyomavirus-Associated Nephropathy in Renal Transplantation: Interdisciplinary Analyses and Recommendations. Transplantation (2005) 79(10):1277-86. doi: doi: 10.1097/01.Tp.0000156165.83160.09
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