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J-GLOBAL ID：202202290559623968   整理番号：22A0027621

ContFree-NGS:次世代シークエンシングデータにおける汚染生物からの読取の除去【JST・京大機械翻訳】

ContFree-NGS: Removing Reads from Contaminating Organisms in Next Generation Sequencing Data

著者 (3件)： Peres Felipe Vaz (Federal University of Sao Carlos, , Sao Paulo, Brazil) ,  Peres Felipe Vaz (Computational, Evolutionary and Systems Biology Laboratory, Center for Nuclear Energy in Agriculture, University of Sao Paulo, , Sao Paulo, Brazil) ,  Riano-Pachon Diego Mauricio (Computational, Evolutionary and Systems Biology Laboratory, Center for Nuclear Energy in Agriculture, University of Sao Paulo, , Sao Paulo, Brazil)
資料名： Lecture Notes in Computer Science  (Lecture Notes in Computer Science)
巻： 13063  ページ： 65-68  発行年： 2022年 
JST資料番号： H0078D  ISSN： 0302-9743  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,your配列決定データセットにおける汚染生物に由来する読取りを除去するオープンソースソフトウェアであるContFree-NGSを提示した。ユーザは目標分類群を提供し,この分類群またはその子孫に属さないことは汚染物質としてラベル付けされるであろう。これを達成するために,ContFree-NGSは,Kraken2またはKaijuのような分類割当てエンジンからの結果を利用する。Copyright Springer Nature Switzerland AG 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *汚染物質
準シソーラス用語： オープンソース ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： NGS ,  汚染 ,  生物情報学

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シークエンシング ,  汚染 ,  生物 ,  読取