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J-GLOBAL ID：202202290760750985   整理番号：22A0438618

カルバペネム耐性Serratia marcescensコホートおよび発生の表現型および遺伝子型特性: 日和見病原体の記述【JST・京大機械翻訳】

Phenotypic and genotypic characteristics of a carbapenem-resistant Serratia marcescens cohort and outbreak: describing an opportunistic pathogen

著者 (14件)： Prado Gladys (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Mendes Elisa Teixeira (Pontifical Catholic University of Campinas, Center of Life Science, Postgraduate Program in Health Science, Infectious Diseases, Campina, Sao Paulo, Brazil) ,  Martins Roberta Cristina Ruedas (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Perdigao-Neto Lauro Vieira (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Freire Maristela Pinheiro (Infection Control Committee of Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Marchi Ana Paula (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Cortes Marina Farrel (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Lima Victor Augusto Camarinha de Castro (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Rossi Flavia (Department of Pathology, Division of Microbiology of the Central Laboratory (LIM 03), Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Guimaraes Thais (Infection Control Committee of Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Levin Anna Sara (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Levin Anna Sara (Department of Infectious and Parasitic Diseases, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Costa Silvia Figueiredo (Medical Research Laboratory, Bacteriology (LIM-49), USP Medical School, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil) ,  Costa Silvia Figueiredo (Department of Infectious and Parasitic Diseases, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil)
資料名： International Journal of Antimicrobial Agents  (International Journal of Antimicrobial Agents)
巻： 59  号： 1  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0278A  ISSN： 0924-8579  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Serratia marcescensは,高い遺伝的多様性を有する新興日和見病原体である。本稿では,カルバペネム耐性S.marcescensによる感染に対する分離株の微生物学的特性と危険因子について述べた。3年間にわたるカルバペネム耐性S.marcescensによる感染(n=43)と感染(n=20)患者の後向き研究を行った。カルバペネマーゼ遺伝子のポリメラーゼ連鎖反応と全ての利用可能な株の分子タイピングを行った。発生時に同定された3つの環境試料を含む42の分離株を分析した。35のカルバペネム耐性S.marcescensはbla_KPC-2,1つの分離株はbla_NDM陽性で,4つの分離株はbla_OXA-101を持っていた。ゲノムを100%ブートストラップで3つのクラスタに分類した。ompCとompFの突然変異の3つのパターンを見出した。菌株は侵入と溶血に関連する病原性遺伝子を持ち,環境株は臨床株よりも毒性遺伝子に少ない変異を示した。多変量解析は,ポリミキシン(P=0.008)の以前の使用がカルバペネム耐性S.marcescens感染の独立危険因子であることを示した。本研究は,ompCまたはompF変異と関連したbla_KPC-2が研究病院における耐性の最も一般的な機構であり,ポリミキシンの以前の使用がカルバペネム耐性S.marcescensの独立危険因子であることを明らかにした。環境分離株を含む優勢なクローンがあり,交差伝達がこの病原体の伝播に関与することを示唆した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多変量解析 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子型 ,  突然変異 ,  *表現型 ,  *霊菌 ,  クラスタ ,  *Serratia ,  *病原体 ,  クローン ,  *母集団 ,  PCR法 ,  危険因子
準シソーラス用語： カルバペネマーゼ ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： カルバペネム耐性Serratia marcescens ,  NDM ,  KPC ,  Serratia marcescens

分類 (4件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  抗生物質の薬理一般  (GX05010R) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

タイトルに関連する用語 (7件)： カルバペネム耐性 ,  Serratia ,  コホート ,  表現型 ,  遺伝子型 ,  病原体 ,  記述