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J-GLOBAL ID：202202290770766888   整理番号：22A1023675

新興多剤耐性Serratia marcescensに対するマルチエピトープベースワクチンの設計に対する系統的免疫情報アプローチ【JST・京大機械翻訳】

A Systematic Immuno-Informatic Approach to Design a Multiepitope-Based Vaccine Against Emerging Multiple Drug Resistant Serratia marcescens

著者 (6件)： Damas Marcelo Silva Folhas (1Departamento de Genetica e Evolucao, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil) ,  Mazur Fernando Gabriel (1Departamento de Genetica e Evolucao, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil) ,  Freire Caio Cesar de Melo (1Departamento de Genetica e Evolucao, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil) ,  Cunha Anderson Ferreira da (1Departamento de Genetica e Evolucao, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil) ,  Pranchevicius Maria-Cristina da Silva (1Departamento de Genetica e Evolucao, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil) ,  Pranchevicius Maria-Cristina da Silva (2Centro de Ciencias Biologicas e da Saude, Biodiversidade Tropical - BIOTROP, Universidade Federal de Sao Carlos, Sao Carlos, Brazil)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 768569  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Serratia marcescensは,現在,入院または免疫不全患者における重大な感染を引き起こす重要な日和見病原体である。ここでは,S.marcescensに対する潜在的ワクチン候補を予測するために,逆ワクチン学およびサブトラクティブプロテオミクスに基づくアプローチに基づく広範な生物情報学分析を用いた。Serratia marcescensの49分離株の完全なプロテオーム配列を分析し,保存された蛋白質,ヒトと腸のフローラから非相同,細胞外または外膜に輸出した,抗原の5つを同定した。同定された蛋白質を用いて,5つのCTL,12のHTL,および12のBCLエピトープ抗原,非アレルゲン性,保存,親水性,および非毒性を選択した。さらに,HTLエピトープはインターフェロンγ免疫応答を誘発することができた。選択したペプチドを用いて,免疫修飾アジュバント,PADRE配列およびリンカーを有する4つのマルチエピトープワクチン構築物(SMV1,SMV2,SMV3およびSMV4)を設計した。ペプチド開裂分析は,抗原ワクチンが処理され,MHCクラス分子を介して提示されることを示した。いくつかの物理化学的および免疫学的分析は,すべてのマルチエピトープワクチンが非アレルゲン性,安定,親水性および可溶性であり,高い抗原性で免疫を誘発することを明らかにした。二次構造分析は,設計したワクチンが主にコイル構造とαヘリックス構造を含むことを明らかにした。3D分析は高品質構造を示した。分子ドッキング分析は,4つの構築したワクチンの中で最良のワクチン構築物としてSMV4を明らかにし,免疫受容体との高い親和性を示した。分子動力学シミュレーションにより,ワクチン候補の低変形性および安定性を確認した。SMV4の不連続エピトープ残基分析は,それらが柔軟であり,抗体と相互作用することを明らかにした。in silico免疫シミュレーションは,設計したSMV4ワクチンが効果的な免疫応答を誘発することを示した。発現ベクターにおけるin silicoコドン最適化とクローニングは,SMV4ワクチンが大腸菌系で効率的に発現できることを示した。全体として,SMV4マルチエピトープワクチンは抗原特異的体液性及び細胞性免疫応答を成功裏に誘発し,S.marcescensに対する潜在的ワクチン候補であることを示した。さらなる実験的検証は,その正確な有効性,安全性および免疫原性プロファイルを確認することができた。著者らの知見は,高い臨床的関連性を有する多剤耐性グラム陰性細菌の広がりを予防し,制御するための新しい戦略の開発への貴重な追加をもたらした。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  安全性 ,  大腸菌 ,  ペプチド ,  抗体 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  *ワクチン ,  グラム陰性菌 ,  二次構造 ,  免疫原性 ,  *霊菌 ,  *エピトープ ,  インターフェロンγ ,  *多剤耐性

著者キーワード (5件)： Serratia marcescens ,  逆ワクチン学 ,  多剤耐性 ,  計算アプローチ ,  サブトラクティブプロテオミクス

分類 (1件)： 免疫療法薬・血液製剤の基礎研究  (GW22010D)

引用文献 (145件)：

• Prestinaci F, Pezzotti P, Pantosti A. Antimicrobial Resistance: A Global Multifaceted Phenomenon. Pathog Global Health (2015) 109:309-18. doi: doi: 10.1179/2047773215Y.0000000030
• Jansen KU, Anderson AS. The Role of Vaccines in Fighting Antimicrobial Resistance (AMR). Hum Vaccines Immunother (2018) 14:2142-9. doi: doi: 10.1080/21645515.2018.1476814
• Micoli F, Bagnoli F, Rappuoli R, Serruto D. The Role of Vaccines in Combatting Antimicrobial Resistance. Nat Rev Microbiol (2021) 19:287-302. doi: doi: 10.1038/s41579-020-00506-3
• Bloom DE, Black S, Salisbury D, Rappuoli R. Antimicrobial Resistance and the Role of Vaccines. Proc Natl Acad Sci USA (2018) 115:12868-71. doi: doi: 10.1073/pnas.1717157115
• AMR Review. Antimicrobial Resistance: Tackling a Crisis for the Health and Wealth of Nations (2014). Available at: https://amr-review.org/sites/default/files/AMR%20Review%20Paper%20-%20Tackling%20a%20crisis%20for%20the%20health%20and%20wealth%20of%20nations_1.pdf (Accessed February 6, 2022). doi: 10.1073/pnas.1717157115

タイトルに関連する用語 (5件)： 多剤耐性 ,  Serratia ,  設計 ,  系統 ,  免疫