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J-GLOBAL ID：202202290798285284   整理番号：22A1030160

単一分子レベルで明らかにしたDNAポリメラーゼの立体配座動力学【JST・京大機械翻訳】

Conformational Dynamics of DNA Polymerases Revealed at the Single-Molecule Level

著者 (1件)： Millar David P. (Department of Integrative Structural and Computational Biology, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA, United States)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 826593  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAポリメラーゼは本質的に動的高分子機械である。本レビューの目的は,大腸菌DNAポリメラーゼIに焦点を当て,DNAポリメラーゼの立体配座動力学を調べるために用いられる単一分子Forster共鳴エネルギー移動(smFRET)法を記述することである。ここでレビューした研究は,Pol Iのヌクレオチド選択,証明および5′ヌクレアーゼ活性を支える立体配座動力学を明らかにする。さらに,Pol Iに対して明らかにされた機構は,DNAポリメラーゼファミリーを通して採用され,smFRET法もDNAポリメラーゼ活性の他の側面を調べるために使用された。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *分子 ,  *立体配座 ,  大腸菌 ,  *DNA【核酸】 ,  *DNAポリメラーゼ ,  ヌクレオチド ,  DNA複製 ,  蛍光共鳴エネルギー移動
準シソーラス用語： DNAポリメラーゼI ,  *単一分子 ,  蛋白質間相互作用 ,  分子機械 ,  共鳴エネルギー移動 ,  ヌクレアーゼ活性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAポリメラーゼ ,  単一分子FRET ,  立体配座動力学 ,  DNA複製忠実度 ,  DNA-蛋白質相互作用

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (76件)：

• BaileyM. F., van der SchansE. J. C., MillarD. P. (2004). Thermodynamic Dissection of the Polymerizing and Editing Modes of a DNA Polymerase. J. Mol. Biol. 336 (3), 673-693. doi: 10.1016/j.jmb.2003.11.023
• BalakrishnanL., BambaraR. A. (2013). Okazaki Fragment Metabolism. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 5 (2), a010173. doi: 10.1101/cshperspect.a010173
• BanerjeeS., MauryaS., RoyR. (2018). Single-molecule Fluorescence Imaging: Generating Insights into Molecular Interactions in Virology. J. Biosci. 43 (3), 519-540. doi: 10.1007/s12038-018-9769-y
• BebenekA., Ziuzia-GraczykI. (2018). Fidelity of DNA Replication-A Matter of Proofreading. Curr. Genet. 64 (5), 985-996. doi: 10.1007/s12038-018-9769-y
• BerezhnaS. Y., GillJ. P., LamichhaneR., MillarD. P. (2012). Single-Molecule Förster Resonance Energy Transfer Reveals an Innate Fidelity Checkpoint in DNA Polymerase I. J. Am. Chem. Soc. 134 (27), 11261-11268. doi: 10.1021/ja3038273

タイトルに関連する用語 (4件)： 単一分子 ,  DNAポリメラーゼ ,  立体配座 ,  動力学