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J-GLOBAL ID：202202291242674029   整理番号：22A0739034

強直性脊椎炎の潜在的病原性遺伝子とメカニズム:WGCNAとバイオインフォマティクス分析に基づく研究【JST・京大機械翻訳】

Potential Pathogenic Genes and Mechanism of Ankylosing Spondylitis: A Study Based on WGCNA and Bioinformatics Analysis

著者 (12件)： Wu Bo (Department of Orthopaedics, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Wu Bo (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Yu Jing (Operating Theatre No. 1, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Liu Yibing (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Dou Gaojing (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Dou Gaojing (Department of Breast Surgery, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Hou Yuanyuan (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Zhang Zhiyun (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Pan Xuefeng (Department of Obstetrics, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Wang Hongyu (Clinical College, Jilin University, Changchun, China) ,  Zhou Pengcheng (Department of Orthopaedics, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Zhu Dong (Department of Orthopaedics, the First Bethune Hospital of Jilin University, Changchun, China)
資料名： World Neurosurgery  (World Neurosurgery)
巻： 158  ページ： e543-e556  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1144A  ISSN： 1878-8750  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,ASの病因の分子機構をさらに詳述し,臨床ASの診断および治療に対する潜在的生物学的標的を提供するために,分子レベルでのバイオインフォマティクス法に基づいた強直性脊椎炎(AS)の発生および発生に対するハイリスク病原性ドライバー遺伝子を調査することである。遺伝子発現プロファイルデータGSE16879をGEO(Gene Expression Omnibus)データベースからダウンロードし,加重遺伝子共発現ネットワーク分析を行った。高度に相関した遺伝子は14のモジュールに分割され,黄色(クラスモジュール)に含まれる582の遺伝子と灰色60(血液学的モジュール)モジュールに含まれる59の遺伝子はASと最も強い相関があった。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)分析の後,最も高いスコアを有するトップ20の遺伝子を,それぞれ古典的モジュールと血液モジュールから得た。DAVID(Annotation,Visualization,およびIntegrated Discovery)データベースを,遺伝子オントロジー分析と遺伝子およびゲノム解析の京都エンシクロペディアのために用いて,ASに関連するハイリスク遺伝子の生物学的機能を分析した。結果は,膜,リボソーム,ニコチンアミドアデニン二リン酸デヒドロゲナーゼ(ユビキノン)活性,血小板活性化,インテグリン複合体,および細胞外マトリックス結合に標的化するシグナル認識粒子依存共翻訳蛋白質のプロセスが豊富であることを示した。本研究では,効率的なシステム生物学アルゴリズムである加重遺伝子共発現ネットワーク解析を用いて,ASの高リスク病原性ドライバー遺伝子を分析した。著者らは,臨床ASの診断と治療およびさらなる研究のための新しいアイデアのための新たな目標を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  ターゲット ,  *情報科学 ,  データベース ,  生物学 ,  *遺伝子 ,  *病原性 ,  複合体 ,  リボソーム ,  遺伝子発現 ,  ターゲティング ,  インテグリン ,  病因
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  *バイオインフォマティクス ,  分子機構 ,  共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 強直性脊椎炎 ,  生物情報学 ,  機構 ,  病原性遺伝子 ,  WGCNA

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 強直性脊椎炎 ,  病原性遺伝子 ,  メカニズム ,  バイオインフォマティクス ,  分析 ,  研究