文献

J-GLOBAL ID：202202292173296265   整理番号：22A1058249

Mycobacterium tuberculosis由来のDosR(休眠生存調節因子)レギュロン蛋白質,Rv2004c(ラフモフォロジーおよび毒性株遺伝子)の阻害剤を同定するための分子モデリングアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Molecular modeling approach to identify inhibitors of Rv2004c (rough morphology and virulent strain gene), a DosR (dormancy survival regulator) regulon protein from Mycobacterium tuberculosis

著者 (7件)： Shanmuga Priya V. G. (Department of Biotechnology, KLE Dr.M.S.Sheshgiri College of Engineering and Technology, Belagavi, India) ,  Bhandare Vishwambhar (Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Bombay, Powai Mumbai, India) ,  Muddapur Uday M. (Department of Biotechnology, B.V.B College of Engineering and Technology, KLE Technological University, Hubballi, India) ,  Swaminathan Priya (Department of Biotechnology, SRM Institute of Science and Technology, Kattankulathur, Chennai, India) ,  Fandilolu Prayagraj M. (Structural Bioinformatics Unit, Department of Biochemistry, Shivaji University, Kolhapur, India) ,  Sonawane Kailas D. (Structural Bioinformatics Unit, Department of Biochemistry, Shivaji University, Kolhapur, India) ,  Sonawane Kailas D. (Department of Microbiology, Shivaji University, Kolhapur, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 7  ページ： 3242-3257  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 休眠生存レギュレータ(DosR)レギュロンの一部で,Rv2004c(粗形態および毒性株遺伝子)は,結核菌の増殖および生存に必要な不可欠な蛋白質として,以前の実験研究で同定されている。この蛋白質は,免疫防御および他の膜関連事象に関連するホスホリパーゼA2活性の阻害に役割を持つと予測された。したがって,Rv2004c蛋白質の重要性を考慮して,構造に基づく薬物設計戦略に続いて,この新規標的に対する潜在的阻害剤を同定した。最初に,標的を検証するために,宿主における相同蛋白質の不在を,ヒトプロテオームに対する配列および構造類似性検索を通して検証した。次に,標的上の潜在的リガンド結合部位を同定し,亜鉛データベース分子に対する仮想スクリーニングを行った。類似体と共にトップスコアリングヒットを,Glideとのドッキング研究に対して行った。Grideヒットのドッキング錯体の結合自由エネルギーは,Schroedingerおよび分子ZINC57990006,ZINC33605742,ZINC71773467およびZINC34198774からのPrimeプログラムによって予測され,この標的に対する潜在的ヒットとして認識された。QikPropとadmetSARツールからの分子の予測薬物動態特性を分析して,ZINC34198774を有効な分子として同定した。分子動力学シミュレーション研究は,ZINC34198774がRv2004cに対する潜在的阻害剤であり得ることを確認した。したがって,本研究から得られた結果は,結核に対する新しい治療法の設計に使用できる。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ターゲット ,  亜鉛 ,  データベース ,  ドッキング ,  結核 ,  宿主 ,  *タンパク質 ,  ヒト ,  *休眠 ,  *結核菌 ,  治療法 ,  *レギュロン ,  ホスホリパーゼA2 ,  プロテオーム
準シソーラス用語： リガンド結合ドメイン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： M.結核 ,  Rv2004c ,  ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  ADME/T

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (12件)： Mycobacterium ,  休眠 ,  生存 ,  調節因子 ,  レギュロン ,  蛋白質 ,  毒性 ,  株 ,  遺伝子 ,  阻害剤 ,  同定 ,  分子モデリング