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J-GLOBAL ID：202202292390044876   整理番号：22A0434000

次世代シークエンシングによるキメラ試験の性能特性【JST・京大機械翻訳】

Performance characteristics of chimerism testing by next generation sequencing

著者 (8件)： Cusick Matthew F. (Department of Pathology, University of Michigan Medicine, 2800 Plymouth Rd., Building 36, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Clark Lauren (Department of Surgery, Baylor College of Medicine, One Baylor Plaza, MS:BCM 504, Houston, TX 77030, USA) ,  Tu Thuydung (Department of Surgery, Baylor College of Medicine, One Baylor Plaza, MS:BCM 504, Houston, TX 77030, USA) ,  Goforth John (Department of Surgery, Baylor College of Medicine, One Baylor Plaza, MS:BCM 504, Houston, TX 77030, USA) ,  Zhang Xiaohai (HLA and Immunogenetics, Laboratory, Cedars-Sinai Medical Center, Lab-SSB 197, 8723 Alden D, Los Angeles, CA 90048, USA) ,  LaRue Bobby (Department of Forensic Science, 1003 Bowers Blvd, Sam Houston, State University Huntsville, TX 77340, USA) ,  Gutierrez Ryan (Department of Forensic Science, 1003 Bowers Blvd, Sam Houston, State University Huntsville, TX 77340, USA) ,  Jindra Peter T. (Department of Surgery, Baylor College of Medicine, One Baylor Plaza, MS:BCM 504, Houston, TX 77030, USA)
資料名： Human Immunology  (Human Immunology)
巻： 83  号： 1  ページ： 61-69  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0289B  ISSN： 0198-8859  CODEN： HUIMDQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キメラ試験は生物学的試料混合物の状態に関する有益な臨床データを提供する。年間,この試験は,キャピラリー電気泳動(CE)を用いて,有益な短いタンデム反復(STR)遺伝子座のピークを測定することによって達成された。次世代シークエンシング(NGS)技術の出現により,ドナー/レシピエント混合物のパーセンテージの定量化は,単一フローセルで実行される試料の大きなバッチでシーケンス読取を用いて容易に行われる。本研究では,ドナー/レシピエント混合物の割合を正確に測定するために,FORENSIC NGSキメラプラットフォームを用いたデータを提示する。STRと単一ヌクレオチド多型(SNP)情報遺伝子座の両方を用いて,1%の限界閾値に対するキメラ性を検出することができた。重要なことに,ドナー検出範囲が1%から10%の範囲で比較すると,NGSとCEキメラ法の間に有意な相関が観察された。さらに,100%の正確度を6回の調査で熟練度試験を通して達成した。この有用性は,祖先SNPプロファイルを用いた固形臓器移植患者に対する適切なドナーの同定を助けるため,これを超えて拡大した。要約すると,NGS法は,臨床試料のキメラ試験のための従来のCEに対する高感度で信頼性のある代替法を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドナー ,  信頼性 ,  生体試料 ,  *キメラ ,  臓器移植 ,  高感度 ,  キャピラリー電気泳動 ,  フローセル ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 縦列反復配列 ,  臨床データ ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： キメラ主義 ,  NGS ,  STR ,  SNP ,  HLA

分類 (2件)： 法医学  (GA03000B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シークエンシング ,  キメラ ,  試験 ,  性能特性