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J-GLOBAL ID：202202294608768250   整理番号：22A0629220

包括的なナノ細孔配列決定法はヒト悪性腫瘍におけるサイクリン依存キナーゼ4(CDK4)の完全な転写景観を解読する【JST・京大機械翻訳】

A comprehensive nanopore sequencing methodology deciphers the complete transcriptional landscape of cyclin-dependent kinase 4 (CDK4) in human malignancies

著者 (4件)： Adamopoulos Panagiotis G. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, National and Kapodistrian University of Athens, Athens, Greece) ,  Athanasopoulou Konstantina (Department of Biochemistry and Molecular Biology, National and Kapodistrian University of Athens, Athens, Greece) ,  Tsiakanikas Panagiotis (Department of Biochemistry and Molecular Biology, National and Kapodistrian University of Athens, Athens, Greece) ,  Scorilas Andreas (Department of Biochemistry and Molecular Biology, National and Kapodistrian University of Athens, Athens, Greece)
資料名： FEBS Journal  (FEBS Journal)
巻： 289  号： 3  ページ： 712-729  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0206B  ISSN： 1742-464X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サイクリン依存性キナーゼ4(CDK4)はサイクリン依存性キナーゼのメンバーであり,シグナル伝達経路,転写調節及び細胞分裂において顕著な役割を持つ蛋白質キナーゼファミリーである。欠損または過活性化CDK4/サイクリンD1経路は細胞増殖を促進し,ヒト癌に関与する。CDK4の生物学的役割は広く研究されているが,正常または病理学的条件下でのそのプレmRNAプロセシング機構は無視されている。このように,新規CDK4 mRNA転写物,特に蛋白質コードの同定は,新しい診断および/または予後バイオマーカーまたは新しい治療標的の同定を導くことができた。本研究では,ΔΨゴールド標準の直接RNA配列決定適用の代わりに,標的化ナノポア配列決定法を設計し,高い配列決定深さを提供し,任意の標的遺伝子の新しいmRNAの徹底的な研究を可能にした。この研究は,ヒトCDK4遺伝子の複雑な転写景観を初めて解明し,新しい選択的スプライシングイベントと蛋白質コード能を有する以前に知られていないCDK4転写物の存在を強調した。ヒト悪性腫瘍における各新規CDK4転写物の相対的発現レベルを,カスタムqPCRベースアッセイで解明した。CDK4転写物(CDK4 v.2-v.42)の広範なスペクトルは,細胞ホメオスタシスおよび病態生理におけるこの基本的キナーゼの正確な機能および意味に関する欠損断片を区別および組み立てる最初の段階である。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  細胞分裂 ,  *転写【遺伝】 ,  ヒト ,  細胞増殖 ,  ホメオスタシス ,  予後 ,  ターゲティング ,  バイオマーカー ,  サイクリンD1 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： *悪性腫瘍 ,  *キナーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 選択的スプライシング ,  CDK4 ,  サイクリン依存キナーゼ ,  長距離配列決定 ,  ナノポア配列決定

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞分裂・増殖  (EF02020D)

タイトルに関連する用語 (8件)： ナノ細孔 ,  ヒト ,  悪性腫瘍 ,  サイクリン依存キナーゼ ,  Cdk4 ,  転写 ,  景観 ,  解読