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J-GLOBAL ID：202202295787129898   整理番号：22A0477813

ハイスループットロングレッドシークエンシングに基づく肝細胞癌細胞におけるB型肝炎ウイルスゲノムの統合モデル【JST・京大機械翻訳】

The integration model of hepatitis B virus genome in hepatocellular carcinoma cells based on high-throughput long-read sequencing

著者 (6件)： Li Weiyang (Jining Medical University, Jining, Shandong 272067, China) ,  Li Weiyang (Collaborative Innovation Center for Birth Defect Research and Transformation of Shandong Province, Jining Medical University, Jining, Shandong 272067, China) ,  Wei Wei (Jining Medical University, Jining, Shandong 272067, China) ,  Hou Fei (Jining Medical University, Jining, Shandong 272067, China) ,  Xu Hanshi (Department of Nasopharyngeal Carcinoma, Sun Yat-sen University Cancer Center, Guangzhou, Guangdong 510275, China) ,  Cui Xiaofang (Jining Medical University, Jining, Shandong 272067, China)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 114  号： 1  ページ： 23-30  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HBV統合と機能は徐々に拡大している。しかし,HBV統合の正確な様式は不明である。著者らの研究において,ハイスループットの長読取配列決定を,肝細胞癌(HCC)細胞におけるHBV統合の完全なモードを研究するために,バイオインフォマティクスと組み合わせた。結果は以下を示した。1)HBV統合イベントのHBV挿入配列は総HBV配列の49.5%を占めた。2)0-1kbpの長さを有する短い挿入セグメントは50%を占め,長い挿入セグメント(>3kbp)はHBV挿入イベントの25%を占めた。3)異なる領域で形成されたブレークポイントには,異なるHBV挿入長さがあった。4)HBV統合事象の発生は,より頻繁な構造変化を伴った。5)完全HBV挿入配列に基づいて,複数のHBV統合パターンを確認した。著者らの研究は,多様な完全なHBV統合モデルを明らかにするだけでなく,HBV統合の複数の特異的特徴も決定した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 挿入配列 ,  B型肝炎 ,  *肝細胞癌
準シソーラス用語： *配列解析 ,  *ウイルスゲノム ,  バイオインフォマティクス ,  *ハイスループット ,  構造変化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： HBV統合 ,  HCC ,  長距離配列決定 ,  HBV挿入配列 ,  染色体転座 ,  完全積分モード

分類 (2件)： 発癌機序・因子  (GE02020C) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 肝細胞 ,  癌細胞 ,  B型肝炎ウイルス ,  ゲノム ,  統合モデル