急性心臓拒絶モデルの空間的トランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Ainasoja O.H.; Hurskainen M.; Ghimire B.; Lahtela J.; Syrjaelae S.; Lemstrom K.

文献

J-GLOBAL ID：202202296304478511 整理番号：22A1118837

急性心臓拒絶モデルの空間的トランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Spatial Transcriptomic Analysis of Acute Heart Rejection Model

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資料名：
巻： 41 号： 4 S ページ： S301 発行年： 2022年
JST資料番号： W3128A ISSN： 1053-2498 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：短報発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

心臓移植(HTx)は,時々末期心臓病に対する唯一の治療であるが,HTx後の生存は限られている。同種移植片損傷,機能障害および失敗の背景にある分子機構を理解することは,患者の転帰の改善に重要である。急速に進化する単一細胞および空間トランスクリプトミクス技術は,心血管疾患の診断および治療に新しい分野を開いた。ここでは,空間トランスクリプトミクス法によるラット心臓移植モデルにおける急性拒絶の細胞機構を検討した。同種(DA-DA)と主要MHCミスマッチ同種異系(DA-WF)レシピエントによる異所性ラット心臓移植モデルにおける急性拒絶の影響を調べた。レシピエントラットを移植5日後に屠殺し,移植片断面をVisium Spatial Gene Expressionプラットフォーム(10xGenomes)で分析した。粗配列読取をSpaceRangerを用いて処理した。すべての主要なデータ解析ステップを,Seuratを用いて実行した。クラスターはいくつかの既知の細胞マーカーの発現に基づいて同定された。全サンプルから,スポットの全17クラスタを同定した。著者らの分析は,2つのクラスターが主に心筋細胞,平滑筋細胞の1つのクラスタ,線維芽細胞の2つのクラスタ,11の免疫細胞と1つの赤血球のクラスタを示した。内皮細胞はユニークなクラスターを形成しなかった。同種HTx単独は,異なる遺伝子発現分析に基づく5つのクラスターにおいて顕著なトランスクリプトーム変化を誘導し,主にある種のマクロファージを有するクラスターの割合を増加させた。同種と同遺伝子群の間では,ほとんどクラスタが不変であった。同種異系群は,主に異なる免疫細胞集団を代表する4つのユニークなクラスター,すなわち,顆粒球,リンパ球および他のサンプルには存在しなかったマクロファージの型を示した。1つのクラスタは出血性領域から赤血球から成っていた。急性拒絶は,心臓の細胞組成を劇的に変化させ,心臓の構造細胞におけるトランスクリプトミクス変化を誘導する。著者らの空間トランスクリプトミクス解析は,急性拒絶後に起こる細胞変化に関する新規トランスクリプトームデータを提供する。この方法は拒絶に関与する細胞及び機構の研究を可能にし,薬物開発及び治療に対する潜在的標的を探す。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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移植免疫

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