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J-GLOBAL ID：202202298489587606   整理番号：22A1178024

汎癌解析はALKBH5が神経膠腫を含む複数の癌型の潜在的な予後および免疫療法バイオマーカーであることを示す【JST・京大機械翻訳】

Pan-Cancer Analysis Shows That ALKBH5 Is a Potential Prognostic and Immunotherapeutic Biomarker for Multiple Cancer Types Including Gliomas

著者 (14件)： Wei Cheng (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Wang Bo (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Peng Dazhao (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Zhang Xiaoyang (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Li Zesheng (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Luo Lin (2Department of Neurosurgery, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  He Yingjie (3Department of Hepatopancreatobiliary Surgery, The Second Hospital of Tianjin Medical University, Tianjin, China) ,  Liang Hao (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Du Xuezhi (3Department of Hepatopancreatobiliary Surgery, The Second Hospital of Tianjin Medical University, Tianjin, China) ,  Li Shenghui (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Zhang Shu (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Zhang Zhenyu (2Department of Neurosurgery, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Han Lei (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China) ,  Zhang Jianning (1Tianjin Neurological Institute, Key Laboratory of Post-Neuroinjury Neuro-repair and Regeneration in Central Nervous System, Ministry of Education and Tianjin City, Tianjin Medical University General Hospital, Tianjin, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 849592  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:AlkB相同体5(ALKBH5)は,複数の癌型の発生,成長および進行と関連するN6-メチルアデノシン(m6A)デメチラーゼである。しかしながら,ALKBH5の生物学的役割は,汎癌データセットで検討されていない。したがって,本研究では,汎癌データセットの包括的バイオインフォマティクス分析を行い,ALKBH5が腫瘍形成を調節する機構を決定した。方法:オンラインウェブサイトとNCBI,UCSC,CCLE,HPA,TIMER2,GEPIA2,cBioPortal,UALCAN,STRING,SangerBox,ImmuCellAl,xCell,およびGenePatternを用いて,複数の癌におけるALKBH5のデータを抽出した。汎がん患者データセットを分析し,ALKBH5発現,遺伝的変化,メチル化状態,および腫瘍免疫の間の関係を決定した。標的スキャン,miRWalk,miRDB,miRabel,LncBaseデータベースおよびサイトスコープツールを用いて,ALKBH5の発現を調節し,lncRNA-miRNA-ALKBH5ネットワークを構築する,マイクロRNA(miRNA)および長い非コードRNA(lncRNA)を同定した。in vitro CCK-8,創傷治癒,Transwell及びM2マクロファージ浸潤アッセイ並びにin vivo異種移植動物実験を実施し,神経膠腫細胞におけるALKBH5の生物学的機能を測定した。結果:汎癌分析は,ALKBH5がいくつかの固形腫瘍でアップレギュレートされることを示した。ALKBH5発現は癌患者の予後と有意に相関した。ALKBH5遺伝子の重複と深い変異を含む遺伝的変化は,いくつかの癌タイプで同定された。ALKBH5遺伝子の変化は腫瘍予後と相関した。GOおよびKEGG濃縮分析は,ALKBH5関連遺伝子が神経膠腫における炎症,代謝および免疫シグナリング経路に富んでいることを示した。ALKBH5発現は免疫チェックポイント(ICP)遺伝子の発現と相関し,免疫療法に対する感受性に影響した。腫瘍発生と進行におけるALKBH5発現を調節するlncRNA-miRNAネットワークを構築した。in vitroおよびin vivo実験は,ALKBH5が神経膠腫細胞の増殖,移動および浸潤を促進し,M2マクロファージをグリオーマ細胞にリクルートすることを示した。結論:ALKBH5は複数の癌型で過剰発現し,免疫細胞の腫瘍浸潤の調節を含むいくつかの機構を介して癌の発生と進行を促進した。本研究は,ALKBH5がいくつかの悪性腫瘍における有望な予後および免疫療法バイオマーカーであることを示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  浸潤 ,  生物学 ,  メチル化 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  炎症 ,  腫瘍 ,  *免疫療法 ,  *神経膠腫 ,  *予後 ,  in vivo実験 ,  in vitro実験 ,  *バイオマーカー
準シソーラス用語： マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ALKBH5 ,  汎癌 ,  予後 ,  免疫 ,  神経膠腫 ,  lncRNA-miRNAALKBH5ネットワーク

分類 (5件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  臨床腫よう学一般  (GE03010Y) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

引用文献 (77件)：

• Chen XY, Zhang J, Zhu JS. The Role of M(6)A RNA Methylation in Human Cancer. Mol Cancer (2019) 18:103. doi: doi: 10.1186/s12943-019-1033-z
• Deng X, Su R, Weng H, Huang H, Li Z, Chen J. RNA N(6)-Methyladenosine Modification in Cancers: Current Status and Perspectives. Cell Res (2018) 28:507-17. doi: doi: 10.1038/s41422-018-0034-6
• Wang T, Kong S, Tao M, Ju S. The Potential Role of RNA N6-Methyladenosine in Cancer Progression. Mol Cancer (2020) 19:88. doi: doi: 10.1186/s12943-020-01204-7
• Dixit D, Prager BC, Gimple RC, Poh HX, Wang Y, Wu Q, et al. The RNA M6a Reader YTHDF2 Maintains Oncogene Expression and Is a Targetable Dependency in Glioblastoma Stem Cells. Cancer Discov (2021) 11:480-99. doi: doi: 10.1158/2159-8290.CD-20-0331
• Kan L, Ott S, Joseph B, Park ES, Dai W, Kleiner RE, et al. A Neural M(6)A/Ythdf Pathway is Required for Learning and Memory in Drosophila. Nat Commun (2021) 12:1458. doi: doi: 10.1038/s41467-021-21537-1

タイトルに関連する用語 (6件)： 癌 ,  解析 ,  神経膠腫 ,  予後 ,  免疫療法 ,  バイオマーカー