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J-GLOBAL ID：202202299474109024   整理番号：22A1030097

肝細胞癌患者におけるスプライセオソーム関連遺伝子の予後値の決定【JST・京大機械翻訳】

Determining the Prognostic Value of Spliceosome-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Patients

著者 (7件)： Liu Jun (1Reproductive Medicine Center, Yue Bei People’s Hospital, Shantou University Medical College, Shaoguan, China) ,  Liu Jun (2Guangdong Provincial Key Laboratory of Infectious Diseases and Molecular Immunopathology, Shantou University Medical College, Shantou, China) ,  Liu Jun (3Medical Research Center, Yue Bei People’s Hospital, Shantou University Medical College, Shaoguan, China) ,  Gu Liming (2Guangdong Provincial Key Laboratory of Infectious Diseases and Molecular Immunopathology, Shantou University Medical College, Shantou, China) ,  Gu Liming (4Department of Microbiology and Immunology, Center of Pathogen Biology and Immunology, Shantou University Medical College, Shantou, China) ,  Zhang Dangui (5Research Center of Translational Medicine, Second Affiliated Hospital of Shantou University Medical College, Shantou, China) ,  Li Wenli (1Reproductive Medicine Center, Yue Bei People’s Hospital, Shantou University Medical College, Shaoguan, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 759792  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:スプライセオソームはmRNA代替スプライシングにおいて重要な役割を果たし,いくつかの腫瘍で異常に発現する。しかし,肝細胞癌(HCC)の進行におけるスプライセオソーム関連遺伝子の潜在的役割は,あまり理解されていない。材料と方法:患者データを公開データベースから得た。発現差と生存分析を用いて,HCC予後におけるスプライセオソーム関連遺伝子の重要性を評価した。これらの遺伝子の潜在的調節機構を探索するために,蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを構築し,単変量および多変量Cox回帰およびランダムフォレスト分析を用いてスクリーニングした。これを5遺伝子予後モデルを作成するために使用した。5遺伝子シグネチャの予後的価値と予測力を,訓練セットにおけるKaplan-Meierと時間依存受信機操作特性分析を用いて評価した。これらの結果を独立した外部セットでさらに検証した。臨床応用を促進するために,ノモグラムを作成し,HCC患者の全生存を予測した。5つの遺伝子の相対的発現をリアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖反応を用いて検出した。結果:分析は,LSM1-7,SNRPB,SNRPD1-3,SNRPE,SNRPF,SNRPGおよびSNRPNがHCC患者における予後バイオマーカーとして使用できることを明らかにした。さらに,5遺伝子リスクモデルは高リスク群と低リスク群を明確に区別できた。さらに,リスクモデルは,腫瘍突然変異負荷,CD8+T細胞の免疫細胞浸潤,ナチュラルキラーT細胞,M2マクロファージ,および免疫チェックポイント阻害剤と関連し,HCC免疫療法におけるこのリスクモデルの予測有効性を示した。結論:スプリセオソーム関連遺伝子と5遺伝子シグネチャは,HCC患者の新しい予後バイオマーカーとして,臨床患者モニタリングと追跡調査を援助する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ノモグラム ,  データベース ,  ネットワーク ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  突然変異 ,  患者監視 ,  計算機アルゴリズム ,  免疫療法 ,  *予後 ,  *肝細胞癌 ,  PCR法 ,  *スプライセオソーム ,  バイオマーカー ,  細胞浸潤
準シソーラス用語： ランダムフォレスト , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： snRNP ,  予後遺伝子 ,  HCC ,  TMB ,  免疫細胞

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (40件)：

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• BearssJ. J., PadiS. K., SinghN., Cardo-VilaM., SongJ. H., MouneimneG., et al (2021). EDC3 Phosphorylation Regulates Growth and Invasion through Controlling P-Body Formation and Dynamics. EMBO Rep. 22 (4), e50835. doi: 10.15252/embr.202050835
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• BrayF., FerlayJ., SoerjomataramI., SiegelR. L., TorreL. A., JemalA. (2018). Global Cancer Statistics 2018: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA: A Cancer J. Clinicians 68 (6), 394-424. doi: 10.3322/caac.21492
• ChenW., OuM., TangD., DaiY., DuW. (2020). Identification and Validation of Immune-Related Gene Prognostic Signature for Hepatocellular Carcinoma. J. Immunol. Res. 2020, 5494858. doi: 10.1155/2020/5494858

タイトルに関連する用語 (5件)： 肝細胞癌 ,  患者 ,  スプライセオソーム ,  遺伝子 ,  予後値