VISDB: Viral Integration Site DataBase

保有機関：

University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (4件)：ゲノム/遺伝子 , 遺伝的多様性 , RNA , 健康/疾患

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 相互作用/パスウェイ

生物種 (9件)： Hepatitis B virus (NCBI Taxonomy ID: 10407) , Human papillomavirus (NCBI Taxonomy ID: 10566) , Human gammaherpesvirus 4 (NCBI Taxonomy ID: 10376) , Adeno-associated virus - 2 (NCBI Taxonomy ID: 10804) , Human immunodeficiency virus (NCBI Taxonomy ID: 12721) , Human T-cell leukemia virus type I (NCBI Taxonomy ID: 11908) , Merkel cell polyomavirus (NCBI Taxonomy ID: 493803) , Murine leukemia virus (NCBI Taxonomy ID: 11786) , Xenotropic MuLV-related virus (NCBI Taxonomy ID: 438045)

概要：

ヒトゲノムに組み込まれたウィルスの統合位置と関連情報のデータベースです。 5 つの DNA 腫瘍ウィルス (HBV、HPV、EBV、MCV、AAV2) と 4 つの RNA レトロウィルス (HIV、MLV、HTLV、XMRV) を含む、9 つの主要なウィルスをカバーしています。データは文献からキュレートしており、各エントリには、融合ウィルスとホスト、検証の有無、検出方法、サンプルタイプ (腫瘍、非腫瘍)、疾患、ウィルス配列、宿主配列、標的遺伝子を制御するための miRNA、上流および下流の配列などを収録しています。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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