資源
J-GLOBAL ID:202210011297795098
研究資源コード:NBDC02605
更新日:2022年03月30日
TerrestrialMetagenomeDB
TerrestrialMetagenomeDB
保有機関:
-
Helmholz-Zentrum for Environmental Research
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
ゲノム/遺伝子
, 個体/種
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 環境
生物種 (2件):
terrestrial metagenome (NCBI Taxonomy ID: 1348798)
, Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2)
概要:
陸生のマイクロバイオーム研究に関わるメタゲノムデータのレポジトリとしてメタデータを収録しているデータベースです。主要レポジトリである MG-RAST と Sequence Read Archive (SRA) からキュレートしたメタゲノムデータを比較、関連付けられるように、データセットのメタデータリストと世界地図からデータを選択できるインタラクティブ地図を備えています。リストにはプロジェクトID、サンプルID、サンプリング環境などが含まれています。リソースDB、シーケンシングプラットフォーム、サンプル形状、サンプリング環境などによる絞り込みが可能です。各メタゲノムデータ自体もダウンロードできるスクリプトが提供されています。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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