EnhancerAtlas 2.0

保有機関：

Johns Hopkins School of Medicine

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , 遺伝的多様性

タグ【データの種類】 (2件)：発現 , 分布

生物種 (9件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823)

概要：

エンハンサーアノテーションを提供するデータベースです。ヒト(hg19)、マウス(mm9)、ハエ(dm3)、線虫(ce10)、ゼブラフィッシュ(danRer10)、ラット(rn5)、酵母(sacCer3)、ニワトリ(galGal4)、ブタ (susScr3) の9種のモデル生物について、複数のハイスループット実験データセット (ヒストン修飾、CAGE、GRO-seq、転写因子結合、DHSなど) に基づいて予測したコンセンサスエンハンサーを収録しています。このデータベースにより、(1)特定のゲノム領域で予測されるエンハンサーの実験的証拠の調査、(2)異なる細胞/組織タイプ間でのエンハンサーの比較、(3)特定の遺伝子に関連するエンハンサーの特定、(4)調節エレメントの予測ができます。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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